156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0260 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  100 
 
 		 376 aa  772    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  98.67 
 
 		 376 aa  763    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  91.73 
 
 		 376 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  78.13 
 
 		 376 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  70.48 
 
 		 370 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  71.08 
 
 		 364 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  67.93 
 
 		 367 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  70.75 
 
 		 369 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  67.79 
 
 		 366 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  59.68 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  56.54 
 
 		 392 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  56.81 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  60.67 
 
 		 374 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  60.06 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  34.88 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  36.48 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.99 
 
 		 516 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.58 
 
 		 510 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  34.41 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  31.17 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  38.05 
 
 		 520 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  38.05 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  38.05 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  38.05 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  38.05 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  38.05 
 
 		 516 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  38.05 
 
 		 520 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  37.74 
 
 		 499 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  37.74 
 
 		 499 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  33.43 
 
 		 479 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  33.24 
 
 		 352 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  35.06 
 
 		 348 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  34.32 
 
 		 451 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  33.7 
 
 		 466 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  28.8 
 
 		 364 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  36.52 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  31.4 
 
 		 362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  33.21 
 
 		 912 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  30.54 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  33.45 
 
 		 857 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 487 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 535 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  29.78 
 
 		 911 aa  93.2  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  30.51 
 
 		 463 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  29.12 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  31.02 
 
 		 535 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  31.43 
 
 		 952 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  31.25 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  29.31 
 
 		 316 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  30.03 
 
 		 526 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  31.62 
 
 		 471 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 487 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  31.62 
 
 		 876 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  28.06 
 
 		 470 aa  87  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  27.03 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  30.19 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  29.86 
 
 		 878 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  29.84 
 
 		 856 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  28.72 
 
 		 969 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  33.88 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  29.05 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  34.07 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  34.19 
 
 		 592 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  34.81 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.6 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  34.88 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  26.92 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  32.52 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  23.86 
 
 		 581 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  28.49 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  33.86 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  28.17 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  24.19 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.01 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  32.14 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  28.38 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  32.09 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  26.05 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  24.81 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  23.21 
 
 		 446 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  26.47 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  25.31 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  33.59 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  26.78 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.41 
 
 		 561 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  28.78 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  28.78 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  28.99 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 334 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  26.7 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  30.61 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  30.71 
 
 		 467 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>