More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4752 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 455 aa  916    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  57.82 
 
 		 912 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  56.47 
 
 		 857 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  53.42 
 
 		 911 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  51.51 
 
 		 952 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  52.95 
 
 		 876 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  54.72 
 
 		 856 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  53.68 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  51.42 
 
 		 878 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  48.46 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  48.81 
 
 		 969 aa  363  4e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  44.84 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  37.91 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  43.89 
 
 		 526 aa  214  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.24 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  37.38 
 
 		 534 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  36.15 
 
 		 535 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.47 
 
 		 487 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  35.47 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 		 535 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 		 535 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 		 535 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  31.2 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  36.98 
 
 		 316 aa  160  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  37.91 
 
 		 307 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  31.94 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  36.2 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  35.08 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  35.9 
 
 		 350 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  35.38 
 
 		 355 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  36.53 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  36.53 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  34.32 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.93 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.93 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.93 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.93 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.93 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.93 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.93 
 
 		 516 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.79 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 516 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  34.67 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  33.85 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  34.49 
 
 		 348 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  35.25 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  31.16 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.71 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  32.4 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  31.72 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  53.15 
 
 		 128 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  32.29 
 
 		 364 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  32.24 
 
 		 341 aa  118  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.24 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  30.34 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  31.32 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  30.23 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  30.13 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  30.54 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.98 
 
 		 527 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  32.39 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  31.18 
 
 		 375 aa  104  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  27.91 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  31.34 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  28.92 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  29.53 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  29.97 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  25.12 
 
 		 505 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  29.36 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  27.53 
 
 		 393 aa  96.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  29.81 
 
 		 376 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  29.09 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  40 
 
 		 166 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  28.97 
 
 		 370 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  29.29 
 
 		 374 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  27.18 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  31.58 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  38.6 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  29.19 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.19 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  29.26 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  32.31 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  32.57 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  35.42 
 
 		 565 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  26.81 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  29.03 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  33.1 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  28.71 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  27.12 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  30.94 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  30.94 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  30.14 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>