65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23270 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  58.87 
 
 		 857 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  56.56 
 
 		 912 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  62.28 
 
 		 876 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  60.18 
 
 		 911 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  56.52 
 
 		 952 aa  133  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  53.15 
 
 		 455 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  53.1 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  49.55 
 
 		 479 aa  117  7e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  48.72 
 
 		 856 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  45.93 
 
 		 878 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  50.39 
 
 		 969 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  47.9 
 
 		 526 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  46.51 
 
 		 463 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  45.22 
 
 		 526 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 487 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  38.39 
 
 		 535 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  41.07 
 
 		 358 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 487 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 535 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 535 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 535 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.61 
 
 		 487 aa  72  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 		 466 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  34.82 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  37.17 
 
 		 481 aa  64.3  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  37.6 
 
 		 534 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  37.14 
 
 		 350 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  37.04 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  34.82 
 
 		 479 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  31.03 
 
 		 486 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  31.68 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  32.32 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  34.82 
 
 		 499 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  34.82 
 
 		 499 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.93 
 
 		 510 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  33.02 
 
 		 348 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  33.01 
 
 		 364 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.04 
 
 		 516 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  33.04 
 
 		 516 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  33.04 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  30.36 
 
 		 366 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  28.57 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  29.7 
 
 		 370 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  29 
 
 		 470 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  31.68 
 
 		 367 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  31 
 
 		 470 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  26.12 
 
 		 314 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  34.34 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.36 
 
 		 444 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  34.34 
 
 		 338 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  28.71 
 
 		 376 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  28.85 
 
 		 352 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  30.39 
 
 		 376 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  28.18 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  27.72 
 
 		 392 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  28.57 
 
 		 391 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  27.72 
 
 		 376 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>