More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3281 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  100 
 
 		 316 aa  653    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  88.92 
 
 		 323 aa  577  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  60 
 
 		 307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  46.67 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  36.14 
 
 		 526 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 		 487 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 535 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 487 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 535 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 535 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 535 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 		 535 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  36.33 
 
 		 912 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  37.23 
 
 		 479 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  36.79 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  35.92 
 
 		 534 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  35.57 
 
 		 876 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  37.65 
 
 		 878 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  38.27 
 
 		 856 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  35.97 
 
 		 857 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  35.23 
 
 		 952 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  33.56 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.18 
 
 		 471 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  32.86 
 
 		 499 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  32.86 
 
 		 499 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  32.73 
 
 		 911 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  31.36 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  32.77 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  31.53 
 
 		 516 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  32.18 
 
 		 520 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  32.18 
 
 		 520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  32.18 
 
 		 520 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  32.18 
 
 		 516 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  32.18 
 
 		 520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  32.18 
 
 		 520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  32.18 
 
 		 520 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  32.17 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  31.53 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  28.53 
 
 		 466 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  30.92 
 
 		 451 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  28.47 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  30.72 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  31.2 
 
 		 526 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  31.18 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  31.03 
 
 		 479 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  29.58 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  30.11 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  26.88 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  31.14 
 
 		 969 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.55 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.25 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  31.38 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  34.38 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  29.87 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  29.93 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  28.35 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  30.07 
 
 		 444 aa  96.3  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  28.48 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  29.39 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  28 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  28.3 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  29.17 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  30.9 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  30.84 
 
 		 341 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  26.94 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.33 
 
 		 527 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  29.23 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  34.01 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  28.17 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  27.52 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  27.64 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  34.84 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.57 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.45 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  27.65 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  25.6 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  32.82 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  29.29 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  28.71 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  25.66 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  27.95 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  30.64 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  25.65 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  30.64 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  26.5 
 
 		 565 aa  76.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  32.29 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  32.51 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  26.45 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  35.34 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  33.7 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  31.31 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  35.34 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  30.46 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  30.46 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  33.15 
 
 		 474 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  26.43 
 
 		 614 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>