More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1019 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  100 
 
 		 526 aa  1057    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  45.58 
 
 		 876 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  40.81 
 
 		 911 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  46.18 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  45.42 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  41.14 
 
 		 487 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  43.57 
 
 		 856 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  45.28 
 
 		 912 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  43.89 
 
 		 455 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  41.14 
 
 		 535 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  43.56 
 
 		 857 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  43.45 
 
 		 526 aa  207  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.8 
 
 		 487 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  44.24 
 
 		 952 aa  204  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.47 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  39.36 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  42.35 
 
 		 878 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  36.14 
 
 		 323 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  39.51 
 
 		 307 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  36.14 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  39.52 
 
 		 969 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  36.8 
 
 		 350 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  37.28 
 
 		 358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.33 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  37.8 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  37.8 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  37.8 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  37.8 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  37.8 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  37.8 
 
 		 516 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  37.8 
 
 		 520 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  39.35 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  37.93 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  37.93 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  37.59 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  36.93 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  37.29 
 
 		 510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  36.4 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  36.7 
 
 		 451 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  36.16 
 
 		 348 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  31.91 
 
 		 314 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  32.99 
 
 		 355 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  34.53 
 
 		 362 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  34.81 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  33.46 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  31.02 
 
 		 364 aa  124  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 444 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.66 
 
 		 355 aa  120  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 341 aa  120  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  29.84 
 
 		 336 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  29.46 
 
 		 331 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  29.46 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 333 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  30.38 
 
 		 338 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  30.77 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  29.55 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  25.37 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  28.98 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  29.74 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  30.34 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  30.59 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.92 
 
 		 358 aa  101  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  28.41 
 
 		 351 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  28.34 
 
 		 470 aa  97.4  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  28.46 
 
 		 312 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  26.65 
 
 		 393 aa  94.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.85 
 
 		 358 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  32.1 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  28.03 
 
 		 364 aa  90.5  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  45.22 
 
 		 128 aa  90.1  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  29.88 
 
 		 640 aa  90.1  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  29.69 
 
 		 376 aa  87.8  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  29.01 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  29.62 
 
 		 391 aa  87  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  35.9 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  30.58 
 
 		 374 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  30.26 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.81 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  27.55 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  28.52 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  30.56 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  28.15 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.99 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  31.42 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.89 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  26.62 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  27.84 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  25.86 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.24 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  29.73 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  29.73 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  29.73 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  27.01 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.71 
 
 		 551 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  29.39 
 
 		 330 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>