More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1136 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 535 aa  1101    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.05 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  25.45 
 
 		 476 aa  164  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  26.64 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  26.64 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.82 
 
 		 460 aa  160  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  26.26 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  27.29 
 
 		 463 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  27.29 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.22 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.22 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  25.3 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  27.6 
 
 		 466 aa  150  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  27.55 
 
 		 551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 		 460 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  25.31 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  25.44 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  25.73 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.38 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.49 
 
 		 496 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  24.83 
 
 		 463 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  25.22 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  26.23 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  25.93 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  24.49 
 
 		 459 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  25.61 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  27.63 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.05 
 
 		 437 aa  136  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  26.62 
 
 		 486 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25.1 
 
 		 519 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  26.47 
 
 		 478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  25.56 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  24.13 
 
 		 594 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.16 
 
 		 460 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  25.1 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  23.25 
 
 		 521 aa  130  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  28.35 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.52 
 
 		 569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.21 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.21 
 
 		 535 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  24.74 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  25.29 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.42 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.8 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  25.42 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  25.4 
 
 		 500 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.32 
 
 		 535 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.31 
 
 		 522 aa  123  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.65 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  24.09 
 
 		 521 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  24.03 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.33 
 
 		 514 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  25.43 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  25.17 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  26.67 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  24.21 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.05 
 
 		 504 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 586 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  27.51 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  24.94 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.97 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.97 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25.7 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 534 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.67 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.76 
 
 		 591 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  26.01 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  26.21 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  24.52 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  23.56 
 
 		 568 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  25.2 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  24.79 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  23.69 
 
 		 599 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.72 
 
 		 519 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  25.11 
 
 		 465 aa  117  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.89 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  25.43 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  26.32 
 
 		 533 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  35.05 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  35.57 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  22.18 
 
 		 705 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  28.83 
 
 		 358 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  24.74 
 
 		 499 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  24.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  24.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  24.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  24.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  24.52 
 
 		 516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  35.05 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 452 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  24.09 
 
 		 563 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  25.86 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  35.05 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>