More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0831 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
331 aa  690    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  66.06 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  60.43 
 
 
334 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  61.92 
 
 
333 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  60.24 
 
 
341 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  62.23 
 
 
333 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  61.23 
 
 
338 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  49.28 
 
 
353 aa  297  2e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  44.51 
 
 
338 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  50 
 
 
351 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  46.01 
 
 
355 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  47.1 
 
 
376 aa  278  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  47.12 
 
 
312 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  49 
 
 
293 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  43.73 
 
 
375 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  34.69 
 
 
419 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  33.99 
 
 
444 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  30.45 
 
 
455 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  31.43 
 
 
463 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  29.46 
 
 
526 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  29.52 
 
 
878 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  28.57 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  29.17 
 
 
911 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  34.71 
 
 
505 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  31.17 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  25 
 
 
350 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.36 
 
 
487 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.13 
 
 
487 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  30.35 
 
 
876 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  29.75 
 
 
856 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  27.21 
 
 
912 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.83 
 
 
487 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.04 
 
 
358 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  28.27 
 
 
857 aa  103  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  28.73 
 
 
952 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  29.03 
 
 
526 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  29.63 
 
 
534 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.6 
 
 
527 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  26.47 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  28.96 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  28.96 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  28.35 
 
 
431 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.64 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  26.69 
 
 
449 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  28.29 
 
 
467 aa  93.6  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  29.74 
 
 
486 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  27.86 
 
 
431 aa  92.4  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  28.13 
 
 
431 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  28.13 
 
 
431 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  28.13 
 
 
431 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  28.66 
 
 
433 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  28.13 
 
 
431 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  28.13 
 
 
431 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  30 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 
455 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 
455 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 
640 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  27.31 
 
 
451 aa  90.9  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 
474 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  30.17 
 
 
375 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  25.1 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  27.44 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  27.44 
 
 
432 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  28.2 
 
 
446 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  27.17 
 
 
448 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  26.87 
 
 
477 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  25.93 
 
 
449 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  30.16 
 
 
460 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  23.56 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  28.97 
 
 
472 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  27.16 
 
 
431 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  26.8 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  25.77 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  26.46 
 
 
466 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  26.14 
 
 
364 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  26.85 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 
471 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  27.47 
 
 
431 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  28.79 
 
 
381 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.56 
 
 
368 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  27.67 
 
 
455 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  26.12 
 
 
462 aa  86.3  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  26.46 
 
 
471 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  28.24 
 
 
359 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  28.35 
 
 
470 aa  85.9  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  27.73 
 
 
462 aa  85.9  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  26.99 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  25.77 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  25.46 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
630 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  26.1 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  28.63 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  28.46 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  26.25 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  26.44 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>