293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1966 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  98.69 
 
 
535 aa  1082    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  98.69 
 
 
535 aa  1082    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  98.77 
 
 
487 aa  991    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  86.24 
 
 
487 aa  858    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  98.69 
 
 
535 aa  1082    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  97.76 
 
 
535 aa  1062    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  100 
 
 
535 aa  1097    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  98.56 
 
 
487 aa  988    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  40.47 
 
 
526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  41.81 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  37.97 
 
 
307 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  31.74 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  34.75 
 
 
466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  38.21 
 
 
876 aa  180  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  37.91 
 
 
952 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  35.96 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  34.47 
 
 
323 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  34.19 
 
 
358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  34.76 
 
 
912 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  32.09 
 
 
481 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  32.97 
 
 
316 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  37.33 
 
 
856 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  34.18 
 
 
314 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  34.84 
 
 
451 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  36.2 
 
 
534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  35.47 
 
 
455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  36.7 
 
 
969 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  36.59 
 
 
857 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 
516 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  35.16 
 
 
350 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.72 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  34.2 
 
 
348 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  34.42 
 
 
911 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  32.01 
 
 
499 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  32.01 
 
 
499 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.17 
 
 
520 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.17 
 
 
516 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.38 
 
 
510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.17 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.17 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.17 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.17 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.17 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  35.37 
 
 
878 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  34.83 
 
 
362 aa  157  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  33.56 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  35.61 
 
 
526 aa  153  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  34.62 
 
 
352 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  32.2 
 
 
479 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  28.19 
 
 
364 aa  143  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  33.45 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  26.29 
 
 
470 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  32.97 
 
 
364 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  32.97 
 
 
370 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.88 
 
 
470 aa  107  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 
331 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  29.71 
 
 
355 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  31.34 
 
 
369 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  23.8 
 
 
527 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
338 aa  97.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  29.78 
 
 
293 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  31.5 
 
 
374 aa  96.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  25.42 
 
 
334 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  27.56 
 
 
393 aa  96.3  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  28.57 
 
 
392 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  31.02 
 
 
376 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  24.8 
 
 
336 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  27.37 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  29.97 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  26.04 
 
 
376 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  25.45 
 
 
341 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  30.66 
 
 
366 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  31.02 
 
 
376 aa  90.9  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  26.22 
 
 
353 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  25.54 
 
 
333 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  29.41 
 
 
376 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  25.54 
 
 
333 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  28.52 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  22.53 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  30.86 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  25.68 
 
 
375 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  26.09 
 
 
312 aa  82  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  24.81 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  25.3 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  24.55 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  21.32 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  28.32 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  21.32 
 
 
554 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  28.32 
 
 
462 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  31.58 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  25.39 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  27.31 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  20.28 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.24 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  23.12 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  29.65 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  20.56 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  26.91 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.1 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>