More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1663 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
353 aa  725    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  79.26 
 
 
351 aa  595  1e-169  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  58.87 
 
 
338 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  54.32 
 
 
355 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  51.15 
 
 
376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  57.31 
 
 
293 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  49.28 
 
 
331 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  50.18 
 
 
336 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  45.19 
 
 
338 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  46.84 
 
 
333 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  46.51 
 
 
333 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  42.86 
 
 
334 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  48.14 
 
 
312 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  47.14 
 
 
341 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  47.63 
 
 
375 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  40.52 
 
 
419 aa  229  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  36.84 
 
 
444 aa  160  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  34.43 
 
 
505 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  31.37 
 
 
463 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  29.37 
 
 
878 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  30.68 
 
 
876 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  27.7 
 
 
857 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  29.74 
 
 
526 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  30.5 
 
 
856 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  29.18 
 
 
912 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  30.74 
 
 
360 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  32.39 
 
 
455 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  28.79 
 
 
358 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 
471 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 
470 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  28.63 
 
 
471 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  30.03 
 
 
470 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  28.35 
 
 
479 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  32.46 
 
 
477 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  28.24 
 
 
911 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  27.76 
 
 
952 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  31.56 
 
 
433 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  26.62 
 
 
350 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  30.8 
 
 
433 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  30.71 
 
 
470 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  31.7 
 
 
431 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  30.8 
 
 
433 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  27.94 
 
 
526 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  30.8 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  31.4 
 
 
373 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  28.02 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  32.08 
 
 
431 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.84 
 
 
487 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  32.08 
 
 
431 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  32.45 
 
 
431 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  28.85 
 
 
484 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  30.65 
 
 
462 aa  96.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  28.05 
 
 
460 aa  96.7  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 
431 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 
431 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  30.65 
 
 
462 aa  96.3  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  32.83 
 
 
431 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  32.08 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
535 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 
431 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  28.05 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  25.77 
 
 
466 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  28.71 
 
 
470 aa  94  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  29.73 
 
 
398 aa  94  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  28.38 
 
 
443 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  28.2 
 
 
468 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  28.43 
 
 
470 aa  92.8  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  27.72 
 
 
510 aa  92.8  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  28.24 
 
 
463 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  27.71 
 
 
460 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  30.43 
 
 
381 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  30.15 
 
 
474 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  29.15 
 
 
448 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  27.15 
 
 
467 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  26.47 
 
 
499 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  28.67 
 
 
449 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  26.47 
 
 
499 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  29 
 
 
449 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  29.25 
 
 
467 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
487 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  26.81 
 
 
534 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  29.64 
 
 
455 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  29.25 
 
 
467 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  26.22 
 
 
535 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 
432 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  30.77 
 
 
432 aa  89.7  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.21 
 
 
487 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  27.67 
 
 
446 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  28.05 
 
 
470 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  29.41 
 
 
467 aa  89  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  28.46 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  26.45 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  28.24 
 
 
452 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>