299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1641 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
526 aa  1045    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  48.75 
 
 
857 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  52.71 
 
 
952 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  53.06 
 
 
911 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  53.25 
 
 
912 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  48.8 
 
 
455 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  46.3 
 
 
856 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  45.12 
 
 
471 aa  348  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  62.67 
 
 
876 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  44.22 
 
 
878 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  42.73 
 
 
969 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  40.23 
 
 
479 aa  289  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  35.09 
 
 
463 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  44.14 
 
 
526 aa  218  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.13 
 
 
487 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 
535 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.33 
 
 
487 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  36.33 
 
 
535 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 
535 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 
535 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.97 
 
 
535 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.61 
 
 
487 aa  159  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  38.1 
 
 
534 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  35.11 
 
 
307 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  31.58 
 
 
323 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  31.58 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  34.67 
 
 
350 aa  137  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  35.14 
 
 
348 aa  136  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  32.42 
 
 
479 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  34.46 
 
 
466 aa  133  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 
355 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  35.02 
 
 
499 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  35.02 
 
 
499 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  33.46 
 
 
358 aa  130  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.3 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  33.45 
 
 
516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  32.37 
 
 
516 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  32.37 
 
 
520 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  29.41 
 
 
451 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  31.88 
 
 
481 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  29.93 
 
 
293 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  33.33 
 
 
352 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.34 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
338 aa  114  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  29.91 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  34.1 
 
 
444 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  30.65 
 
 
341 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  34.45 
 
 
362 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  32.86 
 
 
364 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3471  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 
336 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593576  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1760  multicopper oxidase, types 2 and 3  30.92 
 
 
338 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0831  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 
331 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288801  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23270  hypothetical protein  47.9 
 
 
128 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  28.42 
 
 
376 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 
353 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1131  multicopper oxidase type 3  27.53 
 
 
351 aa  98.2  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.207497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1927  multicopper oxidase type 3  29.44 
 
 
334 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  27.72 
 
 
355 aa  93.6  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3971  multicopper oxidase type 3  28.92 
 
 
312 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  27.67 
 
 
358 aa  90.5  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  28.02 
 
 
358 aa  90.1  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  33.45 
 
 
367 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  27.42 
 
 
333 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4422  multicopper oxidase, type 3  28.06 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  27.02 
 
 
333 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  24.04 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.64 
 
 
527 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  27.92 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  26.26 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  31.62 
 
 
364 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  24.12 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  26.24 
 
 
392 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  25.17 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  27.66 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  28.19 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  31.02 
 
 
376 aa  77  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  24.66 
 
 
472 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  25.56 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  33.03 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  31.68 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  30.1 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  30.52 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  29.22 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  31.37 
 
 
640 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  26.09 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  31.02 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  30.53 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  30.81 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  27.4 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  39.56 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  33.17 
 
 
470 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  32.84 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  32.84 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  31.19 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>