More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2186 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 508 aa  1023    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  51 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  42.43 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  42.64 
 
 		 479 aa  349  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  42.74 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  42.98 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  42.55 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  42.02 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.86 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  34.38 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  32.08 
 
 		 476 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  32.35 
 
 		 466 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.84 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  29.93 
 
 		 437 aa  197  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  29.24 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  29.13 
 
 		 460 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  31.46 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  31.4 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  30.6 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  31.15 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  29.92 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  28.83 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  28.15 
 
 		 463 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  27.73 
 
 		 460 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  27.65 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.68 
 
 		 527 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  27.29 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.38 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  27.63 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  27.07 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  25.45 
 
 		 565 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 457 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.98 
 
 		 546 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  28.07 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  26.09 
 
 		 549 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.89 
 
 		 551 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.89 
 
 		 551 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.27 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.27 
 
 		 554 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  28.98 
 
 		 490 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  29.05 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  27.97 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  27.23 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  30.9 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.64 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  25.58 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  28.99 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 		 535 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.43 
 
 		 477 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  27.33 
 
 		 441 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  30.86 
 
 		 605 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  26.26 
 
 		 504 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  28.34 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  27.03 
 
 		 592 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  29.84 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  27.04 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  29.32 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  25.13 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  23.54 
 
 		 705 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  32.96 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  27.78 
 
 		 664 aa  117  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 359 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  31.11 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  34.05 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  27.34 
 
 		 630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  30.12 
 
 		 640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  32.19 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  30.26 
 
 		 809 aa  114  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  22.41 
 
 		 803 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  30.04 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.77 
 
 		 486 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  24.71 
 
 		 566 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  25.76 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  33.88 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  30 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  30.74 
 
 		 572 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  31.49 
 
 		 621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  45.38 
 
 		 621 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  34.65 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  30.42 
 
 		 579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  25.54 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  45.97 
 
 		 536 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  42.74 
 
 		 607 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  39.29 
 
 		 515 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  30.93 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  42.74 
 
 		 606 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  30.84 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  41.88 
 
 		 669 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  43.1 
 
 		 1064 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  28.15 
 
 		 592 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  32.89 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  33.97 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  31.35 
 
 		 637 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  30 
 
 		 640 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  43.86 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  30 
 
 		 630 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>