17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  100 
 
 		 166 aa  333  5e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  51.65 
 
 		 856 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  43.75 
 
 		 911 aa  90.5  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  48.35 
 
 		 455 aa  87.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  48.24 
 
 		 952 aa  84.3  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  45.65 
 
 		 969 aa  84  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  44.44 
 
 		 878 aa  84  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  44.95 
 
 		 857 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  45.65 
 
 		 912 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  47.06 
 
 		 876 aa  79  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  42.86 
 
 		 479 aa  78.6  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  39.56 
 
 		 526 aa  70.9  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  41.18 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  37.78 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  24.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  33.75 
 
 		 463 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  30.48 
 
 		 828 aa  40.8  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>