225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1610 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1610  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 354 aa  720    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165736  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3162  multicopper oxidase type 3  81.98 
 
 		 371 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  33.69 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.38 
 
 		 544 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.28 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  24.64 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.14 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.14 
 
 		 554 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  24.07 
 
 		 549 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.79 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  23.85 
 
 		 551 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  23.56 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  23.56 
 
 		 551 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  28.7 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.21 
 
 		 592 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.17 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.78 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  31.18 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  30 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.35 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  31.54 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  26.19 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  39.6 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  38.14 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  34.95 
 
 		 594 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  26.71 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  29.58 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  29.58 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.91 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  40.4 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  32.56 
 
 		 626 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  32.62 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  36.63 
 
 		 579 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  26.56 
 
 		 630 aa  63.2  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  34.02 
 
 		 602 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  36.63 
 
 		 606 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  38.1 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  36.63 
 
 		 606 aa  62  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  26.72 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  39.6 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  32.79 
 
 		 627 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  26.49 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4702  multicopper oxidase type 3  36.19 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00279928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  35 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  25.25 
 
 		 664 aa  60.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  29.81 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  32.26 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  32.26 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  31.01 
 
 		 630 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2129  multicopper oxidase family protein  28.92 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  34 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  31.11 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  36.04 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  25.46 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  25.73 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  23.64 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2299  signal peptide protein  35.24 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160622  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  41 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  26.56 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  22.86 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  34.95 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  33.64 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  28.05 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3364  multicopper oxidase, type 3  27.82 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  24.36 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  24.08 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  22.86 
 
 		 672 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  22.86 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  40 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  24.82 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  23.32 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  24 
 
 		 669 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  29.25 
 
 		 656 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  33.96 
 
 		 621 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.04 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  25.53 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  38.14 
 
 		 607 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  23.81 
 
 		 535 aa  56.2  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  28.03 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  34.55 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  33.68 
 
 		 576 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  34.69 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  31.67 
 
 		 536 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  30.48 
 
 		 568 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 		 457 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  34.29 
 
 		 592 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  34.65 
 
 		 614 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  33.65 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  35.42 
 
 		 606 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  32.46 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>