216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3162 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3162  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
371 aa  759    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1610  multicopper oxidase type 3  82.56 
 
 
354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165736  normal  0.896252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  31.09 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  24.93 
 
 
546 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.07 
 
 
544 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.81 
 
 
546 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  24.23 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.35 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  24.23 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  23.6 
 
 
527 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  24.93 
 
 
551 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  24.93 
 
 
551 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  27.92 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  30.5 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  29.05 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.09 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.83 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  30.71 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  30.53 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  27.3 
 
 
600 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  27.94 
 
 
368 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.36 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  41.41 
 
 
565 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  28.85 
 
 
592 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3364  multicopper oxidase, type 3  28.74 
 
 
618 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.82 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.81 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  28.81 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  26.59 
 
 
630 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  39.81 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  27.47 
 
 
579 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  37.25 
 
 
594 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  26.4 
 
 
463 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  37.62 
 
 
606 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4702  multicopper oxidase type 3  37.14 
 
 
504 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00279928  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  37.62 
 
 
606 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  26.64 
 
 
609 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  28.67 
 
 
584 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  38.78 
 
 
293 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  28.39 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2299  signal peptide protein  37.14 
 
 
501 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160622  normal  0.0857051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  25.45 
 
 
602 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 
338 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  38.1 
 
 
581 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  26.89 
 
 
457 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  28.36 
 
 
504 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
498 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  34.31 
 
 
355 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.24 
 
 
640 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  27.55 
 
 
460 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  36 
 
 
561 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  25.35 
 
 
621 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  31.58 
 
 
551 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  24.11 
 
 
669 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2129  multicopper oxidase family protein  26.05 
 
 
574 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  26.16 
 
 
594 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4008  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  24.13 
 
 
604 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  36.08 
 
 
626 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  38 
 
 
499 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  25.17 
 
 
601 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  36.27 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  38 
 
 
499 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  25.17 
 
 
601 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38 
 
 
510 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  35.79 
 
 
664 aa  57.4  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  34.74 
 
 
576 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  35 
 
 
627 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  35.19 
 
 
566 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  31.43 
 
 
656 aa  57  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  34.62 
 
 
564 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  34.58 
 
 
619 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  28.69 
 
 
664 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  38 
 
 
607 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  33.88 
 
 
621 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  31.72 
 
 
535 aa  56.2  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  25.34 
 
 
611 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  35.19 
 
 
574 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  33.33 
 
 
521 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  30.83 
 
 
536 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  34.31 
 
 
630 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  34.31 
 
 
633 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  24.03 
 
 
605 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  23.67 
 
 
652 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  36.36 
 
 
592 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  23.67 
 
 
652 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  30 
 
 
572 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  33.64 
 
 
605 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  38 
 
 
606 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  25.67 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  27.24 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  23.67 
 
 
671 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  35.42 
 
 
580 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  27.21 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  24.54 
 
 
673 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  25 
 
 
373 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  21.58 
 
 
672 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>