190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2231 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 446 aa  882    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  75.12 
 
 		 425 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  53.01 
 
 		 442 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  55.24 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  51.78 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  49.44 
 
 		 440 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  46.19 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  36.94 
 
 		 500 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  35.56 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  35.85 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  36.18 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.94 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  32.2 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  29.55 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.3 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  31.74 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  28.87 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  31.46 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  29.46 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  26.89 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  26.33 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  25.7 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  26.75 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  26.75 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  24.19 
 
 		 457 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  23.97 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  26.49 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  24.09 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  26.91 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  23.93 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  23.82 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  24.88 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  24.09 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  25.52 
 
 		 483 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.07 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  25.79 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  24.84 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  23.56 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  24.52 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  26.44 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  27.05 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  26.87 
 
 		 490 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  23.13 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  24.94 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  25.67 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  24.23 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  24.36 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  22.13 
 
 		 549 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  23.2 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  26.07 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  22.18 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  25.16 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  24.82 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  24.6 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  26.24 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  24.81 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  25 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  24.93 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  22.94 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  26.64 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  27.91 
 
 		 640 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  25.73 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 640 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  23.16 
 
 		 521 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  25.41 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  27.02 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  22.41 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  25 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  25.62 
 
 		 630 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  24.32 
 
 		 656 aa  60.1  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  20.95 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  24.74 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  24.76 
 
 		 574 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  19.76 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  24.75 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  23.79 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  27.38 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.05 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  21.75 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  23.77 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  24.58 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  23.88 
 
 		 606 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  26.2 
 
 		 624 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.06 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  22.33 
 
 		 809 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  23.18 
 
 		 621 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  24.83 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  24.11 
 
 		 612 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  22.92 
 
 		 605 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  22.75 
 
 		 614 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.31 
 
 		 535 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  25.44 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.31 
 
 		 535 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  24.51 
 
 		 631 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  23.96 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.7 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>