More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5132 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  100 
 
 
498 aa  992    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  67.93 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  63.51 
 
 
479 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  63.09 
 
 
479 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  68.11 
 
 
500 aa  595  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  69.18 
 
 
478 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  42.52 
 
 
508 aa  339  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  41.43 
 
 
466 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  38.17 
 
 
460 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  35.03 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  35.03 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.81 
 
 
476 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  31.76 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 
460 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  30.87 
 
 
463 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  29.8 
 
 
463 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  30.65 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 
466 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  29.23 
 
 
470 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  28.81 
 
 
463 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  32.18 
 
 
460 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.72 
 
 
460 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  34.67 
 
 
440 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  31.4 
 
 
456 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  33.83 
 
 
442 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  31.06 
 
 
460 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  32.73 
 
 
425 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  30.53 
 
 
468 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.22 
 
 
457 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  30.68 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 
457 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  31.57 
 
 
446 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  30.24 
 
 
456 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  33.19 
 
 
442 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  30.38 
 
 
461 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.73 
 
 
434 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.73 
 
 
434 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  31.97 
 
 
436 aa  143  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  26.83 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.1 
 
 
592 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  30.42 
 
 
508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  29.98 
 
 
490 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  24.77 
 
 
546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.24 
 
 
544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.55 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  23.78 
 
 
549 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  23.37 
 
 
551 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  23.37 
 
 
551 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.15 
 
 
478 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.98 
 
 
477 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  31.63 
 
 
422 aa  126  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  23.97 
 
 
551 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.68 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.68 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 
565 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  27.03 
 
 
498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.22 
 
 
506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  29.45 
 
 
504 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  24.69 
 
 
521 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.97 
 
 
531 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  24.51 
 
 
521 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  24.94 
 
 
535 aa  108  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  26.49 
 
 
515 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  30.43 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  30.43 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  30.43 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  30.43 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  28.51 
 
 
535 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  30.43 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  28.74 
 
 
532 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.94 
 
 
536 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.94 
 
 
536 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  32.46 
 
 
506 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  27.88 
 
 
535 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  27.88 
 
 
535 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.44 
 
 
489 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 
579 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
536 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
536 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
586 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.73 
 
 
536 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  26.88 
 
 
511 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  30.37 
 
 
457 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  25.32 
 
 
490 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.55 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  27.85 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  25.04 
 
 
551 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  29 
 
 
524 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  25.18 
 
 
513 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 
591 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  26.77 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.25 
 
 
533 aa  97.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  32.33 
 
 
317 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  31.2 
 
 
640 aa  96.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  28.95 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  26.28 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  28.95 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  28.95 
 
 
529 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  27.69 
 
 
373 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>