127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2896 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  81.22 
 
 		 442 aa  685    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 442 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  71.17 
 
 		 440 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  57.18 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  55.59 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  56 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  50.11 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  33.97 
 
 		 479 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  35.1 
 
 		 479 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  35.22 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  35.31 
 
 		 465 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  36.12 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  34.6 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  30.9 
 
 		 508 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  33.52 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  30.26 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  29.1 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  26.37 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  26.11 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  27.65 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  27.06 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  26.25 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  28.67 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  28.67 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  24.87 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  23.42 
 
 		 554 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  23.42 
 
 		 554 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  25.07 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  24.03 
 
 		 546 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  23.28 
 
 		 527 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  26.07 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  23.46 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  22.92 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  25.79 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.3 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  23.18 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  25.33 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  23.85 
 
 		 544 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  22.57 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  22.62 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  23.1 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  22.57 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  22.47 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  22.47 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  25.26 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  24.57 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  23.48 
 
 		 461 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  26.04 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  22.05 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.7 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  23.93 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  22.47 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  25.89 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.81 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  23.39 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  25.55 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  27.19 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  27.6 
 
 		 592 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  27.05 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  23.1 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  24.44 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  24.44 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  21.58 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  24.94 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  26.96 
 
 		 545 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  26.22 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  22.05 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  21.89 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.39 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  24.81 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  27.01 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.57 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  24.02 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.57 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.62 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.57 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.25 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.22 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  25.73 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0041  multicopper oxidase type 2  28.06 
 
 		 487 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  24.65 
 
 		 521 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.06 
 
 		 591 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  26.07 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  25.93 
 
 		 508 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  25.45 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.35 
 
 		 521 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.33 
 
 		 521 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  37.18 
 
 		 576 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  26.19 
 
 		 609 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  20.8 
 
 		 705 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.27 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  27.2 
 
 		 518 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  26.71 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  27.2 
 
 		 518 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>