208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1901 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1901  multicopper oxidase  100 
 
 		 425 aa  844    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.941256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2231  twin-arginine translocation pathway signal  75.24 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0968314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2561  multicopper oxidase  54.52 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.257392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2390  twin-arginine translocation pathway signal  53.32 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2896  multicopper oxidase, type 2  55.59 
 
 		 442 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.104197  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3312  multicopper oxidase type 2  52.52 
 
 		 440 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4576  hypothetical protein  45.02 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  35.7 
 
 		 479 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  36.32 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  35.46 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  33.73 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  33.01 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  29.52 
 
 		 466 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  30.29 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3588  multicopper oxidase type 3  30.92 
 
 		 422 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.185044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  29.13 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  26.01 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  26.01 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  27.67 
 
 		 456 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  27.51 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  27.33 
 
 		 464 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  26.23 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  27.38 
 
 		 460 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  26.23 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  26.37 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  26.3 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  26.07 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  27.27 
 
 		 456 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  25.65 
 
 		 460 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  25.77 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  25.47 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  25.5 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  26.02 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  24.89 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  25.5 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  25.11 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  27.16 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  25.84 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  23.85 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  26.01 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  22.41 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  25.78 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  23.29 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  23.08 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  22.54 
 
 		 546 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  26.55 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  26.55 
 
 		 536 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3882  twin-arginine translocation pathway signal  23.89 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  22.93 
 
 		 527 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  22.78 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  25.35 
 
 		 535 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  21.88 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.33 
 
 		 536 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  28.31 
 
 		 640 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  24.75 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  26.59 
 
 		 591 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  26.58 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  24.82 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  20.6 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  22.41 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  22.41 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  20.6 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  25 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  24.06 
 
 		 605 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  25 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.06 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  27.4 
 
 		 521 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  24.66 
 
 		 607 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  25.51 
 
 		 640 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  24.71 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  24.08 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  26.05 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  24.15 
 
 		 604 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  25.88 
 
 		 624 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  26.19 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  25.1 
 
 		 604 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  26.24 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  23.3 
 
 		 551 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  24.77 
 
 		 605 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  25.77 
 
 		 606 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  24.41 
 
 		 533 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  24.83 
 
 		 612 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  24.58 
 
 		 594 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05690  ferroxidase, putative  23.21 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0562194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  21.29 
 
 		 551 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  23.63 
 
 		 592 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  25.51 
 
 		 630 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>