More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1589 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  68.09 
 
 		 463 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  67.87 
 
 		 463 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  100 
 
 		 470 aa  967    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  61.28 
 
 		 466 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  41.35 
 
 		 437 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  39.09 
 
 		 463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  38.46 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  40.59 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  37.74 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  37.24 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  38.02 
 
 		 461 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  40.81 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  41.06 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  37.02 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  39.56 
 
 		 456 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  38 
 
 		 459 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  37.97 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  37.29 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.79 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  33.89 
 
 		 490 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  36.5 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  36.5 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  34.31 
 
 		 476 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  31.86 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  31.86 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  31.46 
 
 		 508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  29.23 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.45 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  31.22 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 		 479 aa  176  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  30.66 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  31.01 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  29.81 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  29.41 
 
 		 527 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  27.69 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  26.68 
 
 		 546 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  26.18 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  26.18 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  25.73 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  25.73 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  25.64 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  26.79 
 
 		 544 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.84 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  27.42 
 
 		 513 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  24.71 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.57 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  26.51 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.71 
 
 		 490 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.95 
 
 		 592 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  26.58 
 
 		 498 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  27.97 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  27.91 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  26.82 
 
 		 513 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  30.77 
 
 		 496 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  26.89 
 
 		 514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  28.35 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  26.76 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  26.65 
 
 		 513 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  26.85 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.03 
 
 		 497 aa  133  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  27.96 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  26 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  27.53 
 
 		 556 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  26.64 
 
 		 551 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  26.78 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  26.13 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  25.46 
 
 		 506 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  27.55 
 
 		 486 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  26.16 
 
 		 515 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  29.12 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  29.12 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  29.12 
 
 		 535 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.57 
 
 		 521 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  25.65 
 
 		 551 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  24.44 
 
 		 568 aa  123  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  29.19 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  24.32 
 
 		 568 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 		 515 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  25.7 
 
 		 705 aa  119  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  28.44 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 586 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.02 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   25.9 
 
 		 631 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.44 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  29.47 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  27.96 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  27.96 
 
 		 536 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.89 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.84 
 
 		 591 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  27.47 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  26.61 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89638  Multicopper oxidase  27.2 
 
 		 626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.951464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.67 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  26.79 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  23.38 
 
 		 561 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  26.79 
 
 		 502 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>