More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1250 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1103  multicopper oxidase type 3  93.52 
 
 		 463 aa  897    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29261  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1250  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 463 aa  948    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.698191  normal  0.0374375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  68.09 
 
 		 470 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  66.24 
 
 		 466 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  43 
 
 		 437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  39.83 
 
 		 460 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  38.25 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  40.94 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  39.66 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  41.27 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  38.46 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1034  multicopper oxidase  38.05 
 
 		 468 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4192  multicopper oxidase type 3  37.92 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  37.42 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4585  twin-arginine translocation pathway signal  37.1 
 
 		 460 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  36.73 
 
 		 457 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1266  twin-arginine translocation pathway signal  36.46 
 
 		 457 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1031  multicopper oxidase type 3  36.98 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  36.44 
 
 		 460 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3196  multicopper oxidase type 2  36.54 
 
 		 490 aa  249  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.58855  normal  0.965559 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3785  multicopper oxidase type 3  34.51 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.396478  normal  0.420222 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4061  multicopper oxidase type 3  34.51 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 476 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3596  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 434 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0215982  normal  0.135551 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3934  multicopper oxidase type 3  32.03 
 
 		 434 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2369  multicopper oxidase type 3  32.73 
 
 		 500 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2186  multicopper oxidase type 3  31.4 
 
 		 508 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0782192  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2414  multicopper oxidase type 3  31.82 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2677  multicopper oxidase type 3  32.05 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5132  multicopper oxidase type 3  29.21 
 
 		 498 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217654  normal  0.660003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6581  multicopper oxidase type 3  33.64 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7403  multicopper oxidase type 3  31.83 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  27.87 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.51 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  25.56 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0255  multicopper oxidase family protein  25.56 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000165445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  26.92 
 
 		 498 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  27.78 
 
 		 549 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  25.82 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  27.15 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  25.46 
 
 		 551 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  30.57 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  28.41 
 
 		 504 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  25.51 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.12 
 
 		 478 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  28.23 
 
 		 521 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2911  multicopper oxidase type 3  32.41 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4840  multicopper oxidase type 2  28.73 
 
 		 497 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  27.81 
 
 		 506 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1136  multicopper oxidase type 3  25.28 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174058 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C01  putative multicopper oxidase  27.25 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7879  multicopper oxidase type 2  25.7 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  27.41 
 
 		 492 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  26.78 
 
 		 705 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4869  Putative multicopper oxidase-like protein  29.05 
 
 		 592 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778273  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  25.79 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  27.25 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  31.41 
 
 		 535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  27.36 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  35.69 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  27.54 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  25.86 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89638  Multicopper oxidase  26.87 
 
 		 626 aa  118  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.951464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  28.06 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  30.88 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  30.88 
 
 		 535 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  27.07 
 
 		 564 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4421  multicopper oxidase, type 3  27.57 
 
 		 494 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  25.82 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  30.14 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.78 
 
 		 561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  31.95 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.75 
 
 		 547 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  24.56 
 
 		 746 aa  113  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  28.71 
 
 		 533 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.76 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  25.24 
 
 		 513 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  25.91 
 
 		 568 aa  109  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  28.6 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.95 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  28.6 
 
 		 536 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 536 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 536 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  23.12 
 
 		 580 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 536 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  24.46 
 
 		 594 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 579 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  29.7 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  25.06 
 
 		 513 aa  106  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   24.09 
 
 		 631 aa  106  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  24.61 
 
 		 570 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.76 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3408  multicopper oxidase type 2  29.88 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  26.81 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  28.99 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  27.15 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.05 
 
 		 569 aa  104  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  25.4 
 
 		 568 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  25.96 
 
 		 519 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>