208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1072 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1431    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  59.04 
 
 		 687 aa  786    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  53.65 
 
 		 625 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  54.29 
 
 		 647 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  50.29 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  46.46 
 
 		 677 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  48.17 
 
 		 676 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  43.52 
 
 		 840 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  43.24 
 
 		 698 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  37.93 
 
 		 1094 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  36.26 
 
 		 620 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  34.08 
 
 		 708 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  32.86 
 
 		 625 aa  263  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  34.07 
 
 		 523 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  31.39 
 
 		 779 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  30.25 
 
 		 779 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  29.25 
 
 		 872 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  31.33 
 
 		 661 aa  233  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  30.04 
 
 		 647 aa  231  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.02 
 
 		 798 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.02 
 
 		 799 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  28.43 
 
 		 798 aa  210  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 		 734 aa  195  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.75 
 
 		 536 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  28.34 
 
 		 643 aa  174  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  30.37 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  30.26 
 
 		 508 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.34 
 
 		 515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  29.73 
 
 		 679 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  29.5 
 
 		 628 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  29.41 
 
 		 496 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  28.8 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.64 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  30.16 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  24.65 
 
 		 512 aa  133  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  27.4 
 
 		 536 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.69 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  27.25 
 
 		 499 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  26.53 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  25.27 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  28.25 
 
 		 505 aa  114  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  26.3 
 
 		 547 aa  112  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  27.89 
 
 		 519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  25.31 
 
 		 527 aa  111  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  24.84 
 
 		 504 aa  109  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  26.74 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  27.51 
 
 		 877 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  26.54 
 
 		 516 aa  107  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  27.43 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  26.4 
 
 		 551 aa  104  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  25.47 
 
 		 1247 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  27.01 
 
 		 488 aa  101  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  26.44 
 
 		 603 aa  100  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  25.44 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  25.22 
 
 		 529 aa  100  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  25.22 
 
 		 529 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  25.22 
 
 		 529 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.46 
 
 		 532 aa  99.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.58 
 
 		 534 aa  99.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  25 
 
 		 516 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  25.26 
 
 		 524 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  24.58 
 
 		 534 aa  99.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  25.6 
 
 		 539 aa  99.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  26.5 
 
 		 533 aa  99  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  25.22 
 
 		 516 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  25.22 
 
 		 516 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  25.22 
 
 		 516 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  25.22 
 
 		 516 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  23.51 
 
 		 551 aa  97.8  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.06 
 
 		 579 aa  94  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  26.39 
 
 		 535 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  25.51 
 
 		 492 aa  92.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.01 
 
 		 1363 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  24.55 
 
 		 536 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  24.55 
 
 		 536 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.24 
 
 		 519 aa  91.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  26.45 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  26.45 
 
 		 535 aa  91.3  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  24.55 
 
 		 536 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  24.35 
 
 		 536 aa  90.9  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  25.99 
 
 		 535 aa  90.5  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  27.38 
 
 		 1363 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2440  multicopper oxidase type 3  25.62 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.375072  unclonable  0.0000000000413546 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0487  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0682  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 		 536 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1016  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 		 536 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0131  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.99 
 
 		 536 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  30.73 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  30.73 
 
 		 502 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  25.34 
 
 		 493 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0957  multicopper oxidase family protein  25.99 
 
 		 536 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0961  multicopper oxidase family protein  25.99 
 
 		 536 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00373181  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2569  multicopper oxidase, type 3  24.94 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000231161  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  24.32 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  24.83 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  22.22 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1110  mulitcopper oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000312715  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 1272 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  24.66 
 
 		 895 aa  84  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>