239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2658 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  57.76 
 
 		 631 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  58.56 
 
 		 625 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 676 aa  1363    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  88.04 
 
 		 677 aa  1176    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  57.47 
 
 		 647 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  48.17 
 
 		 706 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  46.49 
 
 		 687 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  40.6 
 
 		 840 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  43.02 
 
 		 698 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  37.22 
 
 		 1094 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  34.81 
 
 		 625 aa  300  7e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  35.74 
 
 		 620 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  34.1 
 
 		 708 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  31.38 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  36.75 
 
 		 523 aa  259  9e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  28.99 
 
 		 515 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  30.55 
 
 		 779 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  29.89 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  32.77 
 
 		 872 aa  191  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  31.87 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  29.73 
 
 		 779 aa  183  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  29.53 
 
 		 647 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  31.68 
 
 		 528 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  30.95 
 
 		 799 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  30.54 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  31.32 
 
 		 798 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  27.06 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.91 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.04 
 
 		 798 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  31.31 
 
 		 496 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  27.87 
 
 		 628 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  27.12 
 
 		 643 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  29.83 
 
 		 490 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  29.13 
 
 		 547 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29.64 
 
 		 486 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  30.13 
 
 		 551 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  28.51 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  28.78 
 
 		 527 aa  138  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  26.48 
 
 		 536 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  25.7 
 
 		 895 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  27.64 
 
 		 510 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  25.87 
 
 		 1131 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 516 aa  125  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  27.46 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  26.01 
 
 		 1131 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.96 
 
 		 528 aa  122  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  27.07 
 
 		 877 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  26.01 
 
 		 504 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  26.04 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  25 
 
 		 1201 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  28.7 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  24.57 
 
 		 534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.45 
 
 		 534 aa  112  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  29.21 
 
 		 499 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  28.91 
 
 		 532 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6135  Bilirubin oxidase  24.64 
 
 		 538 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  24.94 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  25.29 
 
 		 760 aa  105  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1131 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  27.34 
 
 		 505 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.43 
 
 		 533 aa  103  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  25.37 
 
 		 464 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  28.37 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  24.67 
 
 		 524 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0353  multicopper oxidase family protein  23.6 
 
 		 514 aa  100  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0624593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  27.38 
 
 		 603 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  27.86 
 
 		 945 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  25.85 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  25.85 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0773  multicopper oxidase type 3  25.25 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0409075  hitchhiker  0.000000280104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  25.85 
 
 		 536 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  29.38 
 
 		 570 aa  94.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  24.84 
 
 		 536 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  24.84 
 
 		 536 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1178  multicopper oxidase type 3  27.27 
 
 		 575 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  24.82 
 
 		 535 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  29.28 
 
 		 502 aa  93.2  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  29.28 
 
 		 502 aa  93.2  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  25.48 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  25.24 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  25.48 
 
 		 535 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  25.05 
 
 		 533 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  21.29 
 
 		 513 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  30.7 
 
 		 645 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  26.99 
 
 		 1247 aa  91.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  27.22 
 
 		 936 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1508  oxidoreductase, putative  21.53 
 
 		 513 aa  90.5  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5853  multicopper oxidase, type 3  24.32 
 
 		 535 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000719829  normal  0.33279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  31.43 
 
 		 539 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  25.38 
 
 		 470 aa  88.2  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  28.32 
 
 		 542 aa  87.4  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0760  mulitcopper oxidase domain-containing protein  23.59 
 
 		 579 aa  87.4  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954855  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1304  multicopper oxidase family protein  24.57 
 
 		 522 aa  87  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.177898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  29.47 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>