85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2163 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  46.09 
 
 		 1303 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  40.59 
 
 		 1308 aa  749    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  44.7 
 
 		 1430 aa  698    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  44.44 
 
 		 1601 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  45.85 
 
 		 1363 aa  705    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  47.42 
 
 		 1736 aa  786    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  49.12 
 
 		 1272 aa  753    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  46.54 
 
 		 1380 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  46.16 
 
 		 1363 aa  707    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 1201 aa  2427    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  42.41 
 
 		 1299 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  41.8 
 
 		 1299 aa  635  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  42.39 
 
 		 1247 aa  628  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  40.26 
 
 		 1248 aa  602  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  42.03 
 
 		 1973 aa  525  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  35.99 
 
 		 1094 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  60.68 
 
 		 534 aa  361  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  32.74 
 
 		 734 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  56.12 
 
 		 883 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  42.95 
 
 		 514 aa  209  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  46.49 
 
 		 491 aa  204  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  40.16 
 
 		 649 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.91 
 
 		 868 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  24.79 
 
 		 677 aa  121  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  33.01 
 
 		 620 aa  119  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  33.67 
 
 		 288 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  28.17 
 
 		 631 aa  104  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  29.32 
 
 		 708 aa  103  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  30.85 
 
 		 840 aa  102  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  25.42 
 
 		 625 aa  102  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  29.41 
 
 		 798 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  29.71 
 
 		 799 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  30.43 
 
 		 661 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  27.39 
 
 		 647 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  29.79 
 
 		 798 aa  95.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  31.01 
 
 		 872 aa  95.1  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.22 
 
 		 625 aa  94.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  26.43 
 
 		 779 aa  93.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  25.48 
 
 		 779 aa  92  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  26.91 
 
 		 523 aa  90.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  31.54 
 
 		 698 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  30.13 
 
 		 676 aa  84.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  28.94 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  27.62 
 
 		 687 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  35 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  27.72 
 
 		 706 aa  80.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.82 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 254 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.77 
 
 		 620 aa  69.7  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  22.19 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  26.36 
 
 		 3041 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1328 aa  66.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  25.88 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.9 
 
 		 690 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  25.98 
 
 		 508 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33 
 
 		 354 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  26.79 
 
 		 679 aa  56.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  23.1 
 
 		 496 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.56 
 
 		 505 aa  54.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  29.24 
 
 		 828 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.82 
 
 		 760 aa  53.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  30.54 
 
 		 1517 aa  53.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  25.1 
 
 		 528 aa  53.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  29.17 
 
 		 470 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.85 
 
 		 486 aa  51.6  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.39 
 
 		 512 aa  50.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.83 
 
 		 690 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1103  hypothetical protein  39.24 
 
 		 76 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0650197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  30.6 
 
 		 861 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  28.04 
 
 		 417 aa  48.9  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  28.33 
 
 		 912 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1289 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  25.23 
 
 		 570 aa  47  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27 
 
 		 409 aa  46.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  22.22 
 
 		 628 aa  46.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.32 
 
 		 1154 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  31.73 
 
 		 487 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.42 
 
 		 354 aa  46.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  25.91 
 
 		 527 aa  45.8  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  25.11 
 
 		 435 aa  45.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  31.34 
 
 		 532 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  33.75 
 
 		 510 aa  45.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1025  hypothetical protein  32.77 
 
 		 288 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  23.6 
 
 		 515 aa  45.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  40 
 
 		 536 aa  44.7  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>