115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0649 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  59 
 
 		 1131 aa  1113    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  57.13 
 
 		 936 aa  1042    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  59 
 
 		 1131 aa  1115    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  59.11 
 
 		 1131 aa  1115    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  100 
 
 		 945 aa  1967    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  64.09 
 
 		 895 aa  1228    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  54.29 
 
 		 877 aa  949    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  25.73 
 
 		 603 aa  158  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  29.93 
 
 		 760 aa  144  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  22.71 
 
 		 536 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  22.56 
 
 		 647 aa  98.6  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  26.17 
 
 		 625 aa  96.3  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  25.36 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  24.13 
 
 		 515 aa  92.8  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  27.35 
 
 		 631 aa  92  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.25 
 
 		 528 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  26.1 
 
 		 677 aa  90.1  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  24.54 
 
 		 536 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  28.28 
 
 		 679 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  27.86 
 
 		 676 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  25.63 
 
 		 512 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  23.26 
 
 		 798 aa  79.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  22.58 
 
 		 698 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3480  multicopper oxidase  23.99 
 
 		 533 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  27.44 
 
 		 708 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3352  multicopper oxidase  23.75 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1021  multicopper oxidase  23.52 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  24.41 
 
 		 625 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  22.29 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  23.95 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  25.33 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  27.16 
 
 		 647 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  30.19 
 
 		 645 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  27.76 
 
 		 872 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  23.58 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  24.72 
 
 		 706 aa  69.3  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  21.13 
 
 		 798 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  26.5 
 
 		 523 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.12 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  23.83 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  22.04 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  22.22 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  29 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  22.98 
 
 		 528 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  25.96 
 
 		 779 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  23.46 
 
 		 533 aa  56.2  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  25.33 
 
 		 542 aa  55.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0359  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 464 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  22.27 
 
 		 536 aa  54.7  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  22.01 
 
 		 536 aa  54.7  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  22.01 
 
 		 536 aa  54.7  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  35.71 
 
 		 492 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  22.27 
 
 		 1094 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  26.47 
 
 		 502 aa  54.3  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  26.47 
 
 		 502 aa  54.3  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  21.78 
 
 		 536 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  21.78 
 
 		 536 aa  53.9  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1101  multicopper oxidase family protein  29.81 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  35.71 
 
 		 499 aa  53.5  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0331  multicopper oxidase type 2  31.36 
 
 		 483 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.060722 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  20.6 
 
 		 510 aa  52.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0198  multicopper oxidase, type 3  33.02 
 
 		 492 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2154  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 515 aa  52  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000232298  normal  0.28588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  22.88 
 
 		 628 aa  52  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  21.21 
 
 		 620 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  25.48 
 
 		 643 aa  50.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.88 
 
 		 532 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2296  multicopper oxidase  34.74 
 
 		 551 aa  50.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  19.77 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  19.77 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  19.81 
 
 		 516 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  26.67 
 
 		 496 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  19.81 
 
 		 516 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  19.81 
 
 		 516 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  19.81 
 
 		 529 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  19.81 
 
 		 529 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  19.81 
 
 		 516 aa  49.7  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  29.55 
 
 		 519 aa  48.9  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  19.81 
 
 		 529 aa  48.9  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  32.88 
 
 		 493 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  25.73 
 
 		 470 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  32.88 
 
 		 493 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  37.61 
 
 		 490 aa  48.1  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  25.56 
 
 		 504 aa  47.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  30.84 
 
 		 499 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  20.25 
 
 		 516 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  31.25 
 
 		 505 aa  47.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4709  multicopper oxidase type 3  29.9 
 
 		 515 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  21.13 
 
 		 734 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  36.11 
 
 		 488 aa  47  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  29.17 
 
 		 527 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2011  multicopper oxidase family protein  32.41 
 
 		 570 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1456  multicopper oxidase  31.82 
 
 		 457 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>