148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4297 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  59.85 
 
 		 1131 aa  989    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2001  multicopper oxidase, type 2  59.57 
 
 		 936 aa  969    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  100 
 
 		 877 aa  1805    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  59.3 
 
 		 1131 aa  984    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  58.24 
 
 		 1131 aa  967    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0649  multicopper oxidase type 2  54.29 
 
 		 945 aa  949    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  59 
 
 		 895 aa  979    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0069  Bilirubin oxidase  32.91 
 
 		 603 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6341  Bilirubin oxidase  28.29 
 
 		 760 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.34 
 
 		 536 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  25.83 
 
 		 536 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  29.19 
 
 		 679 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  27.32 
 
 		 512 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.19 
 
 		 515 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  25.13 
 
 		 528 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  26.68 
 
 		 508 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  27.06 
 
 		 647 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  28.01 
 
 		 631 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  26.01 
 
 		 625 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  26.86 
 
 		 625 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  27.17 
 
 		 677 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  27.96 
 
 		 569 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.6 
 
 		 523 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  24.73 
 
 		 487 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  24.87 
 
 		 547 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  27.51 
 
 		 706 aa  108  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  27.07 
 
 		 676 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  28.12 
 
 		 708 aa  101  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  26.23 
 
 		 698 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  24.89 
 
 		 486 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4907  Bilirubin oxidase  25.11 
 
 		 499 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  24.02 
 
 		 798 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  27.02 
 
 		 647 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  25.52 
 
 		 872 aa  89.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  24.68 
 
 		 840 aa  89  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  24.94 
 
 		 496 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  24.95 
 
 		 779 aa  87.4  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  24.26 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  24.82 
 
 		 779 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  25.33 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  22.71 
 
 		 798 aa  84.7  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  25.88 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  23.39 
 
 		 1094 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  22.25 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  23.46 
 
 		 488 aa  82.8  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  29.72 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  24.02 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  25.63 
 
 		 528 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  24.55 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0671  multicopper oxidase  24.13 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0397341  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  23.61 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1679  Bilirubin oxidase  26.27 
 
 		 542 aa  77  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  25.35 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  25.35 
 
 		 502 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  24.94 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  24.72 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  23.32 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  23.73 
 
 		 661 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  24.53 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  21.95 
 
 		 628 aa  72.4  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  23.41 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0192  multicopper oxidase  23.38 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.105119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0200  multicopper oxidase  23.38 
 
 		 536 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1440  cell division protein SufI  25.46 
 
 		 519 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0184  multicopper oxidase  23.22 
 
 		 536 aa  70.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0133  multicopper oxidase  23.14 
 
 		 516 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0187  multicopper oxidase  23.22 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.402842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0183  multicopper oxidase  23.22 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  25.97 
 
 		 643 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0130  multicopper oxidase  23.03 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00889109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  26.94 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00122  multicopper oxidase (laccase)  22.93 
 
 		 516 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3479  multicopper oxidase type 3  22.93 
 
 		 516 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0863682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0126  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0105298  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0125  multicopper oxidase  22.71 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.781012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00121  hypothetical protein  22.93 
 
 		 516 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0829628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3536  multicopper oxidase  22.93 
 
 		 516 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0116  multicopper oxidase  22.83 
 
 		 529 aa  67.4  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  24.91 
 
 		 620 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  23.06 
 
 		 539 aa  66.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3509  multicopper oxidase type 3  25.31 
 
 		 516 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  25 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  28.36 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  28.36 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0304  multicopper oxidase type 3  33.65 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  28.36 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  28.36 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0139  multicopper oxidase type 3  33.65 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  23.25 
 
 		 734 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  27.86 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1910  multicopper oxidase, type 3  22.98 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000723324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2521  multicopper oxidase, type 3  22.98 
 
 		 535 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  27.86 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  27.86 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2546  multicopper oxidase type 3  22.52 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000092872  decreased coverage  0.00000000165067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  27.86 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4283  multicopper oxidase type 3  35.51 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4343  multicopper oxidase type 3  35.24 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.40342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3609  repressor protein for FtsI  22.39 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3767  repressor protein for FtsI  26.73 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>