222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2165 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  54.32 
 
 		 840 aa  790    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  100 
 
 		 1094 aa  2208    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  43.38 
 
 		 625 aa  552  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  41.14 
 
 		 647 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  35.99 
 
 		 1201 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  39.47 
 
 		 631 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  37.93 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  38.11 
 
 		 698 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  37.52 
 
 		 687 aa  415  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  36.72 
 
 		 677 aa  406  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  37.22 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  58.11 
 
 		 534 aa  353  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  53.36 
 
 		 883 aa  300  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  31.05 
 
 		 708 aa  279  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  33.43 
 
 		 620 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  28.23 
 
 		 779 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  48.39 
 
 		 514 aa  214  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  47.08 
 
 		 491 aa  214  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  27.5 
 
 		 625 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.51 
 
 		 779 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  27.75 
 
 		 798 aa  207  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  28.99 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  28.25 
 
 		 872 aa  198  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  26.79 
 
 		 647 aa  197  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 		 734 aa  189  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  26.44 
 
 		 798 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  27.69 
 
 		 799 aa  172  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  41.43 
 
 		 649 aa  172  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.74 
 
 		 868 aa  147  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  25.58 
 
 		 1363 aa  142  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  30.77 
 
 		 523 aa  142  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  25.67 
 
 		 1380 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  30.7 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  29.6 
 
 		 1363 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 		 1272 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  27.3 
 
 		 536 aa  104  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  26.69 
 
 		 1308 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  26.81 
 
 		 515 aa  101  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  28.81 
 
 		 1430 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  27.41 
 
 		 528 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  27.54 
 
 		 508 aa  96.3  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  35.07 
 
 		 562 aa  95.1  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  30.29 
 
 		 643 aa  91.3  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  26.01 
 
 		 1303 aa  90.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  31.98 
 
 		 828 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  31.55 
 
 		 1973 aa  84.7  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  23.39 
 
 		 877 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  31.9 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2277  multicopper oxidase  22.57 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.849465 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  39.42 
 
 		 496 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4517  Bilirubin oxidase  21.7 
 
 		 547 aa  77.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  23.75 
 
 		 1247 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  24.85 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  33.71 
 
 		 1736 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  25.98 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0704  multicopper oxidase  22.26 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  37.59 
 
 		 628 aa  74.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  21.57 
 
 		 895 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A31  putative multicopper oxidase  37.62 
 
 		 510 aa  74.3  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.517552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  30.31 
 
 		 690 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0660  multicopper oxidase  22.08 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  22.7 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3828  multicopper oxidase  19.96 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  32.14 
 
 		 569 aa  71.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  32.73 
 
 		 470 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1328 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  36.04 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  29.12 
 
 		 1248 aa  68.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0009  putative multicopper oxidase  34.95 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00619677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3341  multicopper oxidase type 2  34.43 
 
 		 1087 aa  68.6  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.526003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0492  multicopper oxidase type 2  24.47 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27.84 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1517 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  26.42 
 
 		 1601 aa  67.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3504  multicopper oxidase, type 3  32.33 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.380863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5811  Bilirubin oxidase  26.38 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  31.27 
 
 		 760 aa  67.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  23.87 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  23.87 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  34.55 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  34.12 
 
 		 1299 aa  65.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  33.63 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1277  multicopper oxidase type 3  33.33 
 
 		 1056 aa  65.1  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0018  multicopper oxidase  23.43 
 
 		 767 aa  64.3  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.49512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 		 1154 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1689  oxidoreductase, putative  31.96 
 
 		 513 aa  63.9  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  33.53 
 
 		 1299 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  31.9 
 
 		 527 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2113  Bilirubin oxidase  28.47 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1576  Bilirubin oxidase  34.29 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4328  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3308  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  0.0130524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3454  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3485  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02889  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3195  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3999  multicopper oxidase  24.62 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0680  repressor protein for FtsI  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02839  hypothetical protein  24.29 
 
 		 470 aa  62  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>