18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4328 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1025  hypothetical protein  81.93 
 
 		 288 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  34.21 
 
 		 883 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  37 
 
 		 534 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.7 
 
 		 1094 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  38.83 
 
 		 649 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.67 
 
 		 1201 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  31.9 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  34.09 
 
 		 562 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  31.9 
 
 		 514 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.14 
 
 		 868 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 635 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 621 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 2497 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  30.59 
 
 		 456 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  26.09 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.81 
 
 		 690 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>