21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3122 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  100 
 
 		 254 aa  482  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  41.63 
 
 		 562 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  31.9 
 
 		 1094 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 1201 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  36.79 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  30.59 
 
 		 883 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  31.79 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  31.61 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1328 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.89 
 
 		 868 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  35.75 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  30.52 
 
 		 1126 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 649 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1517 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 620 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  28.83 
 
 		 2528 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  24.78 
 
 		 2474 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  26.09 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  29.53 
 
 		 417 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.96 
 
 		 1019 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  26.02 
 
 		 780 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>