63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2168 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  100 
 
 		 534 aa  1060    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  76.6 
 
 		 916 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  57.01 
 
 		 1201 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  58.11 
 
 		 1094 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  65.66 
 
 		 777 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  55.8 
 
 		 883 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  57.42 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1380  FG-GAP repeat-containing protein  45.56 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  45.56 
 
 		 491 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  45.14 
 
 		 649 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4328  hypothetical protein  37 
 
 		 288 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.01 
 
 		 868 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  53.64 
 
 		 1141 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  51.09 
 
 		 827 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  44.17 
 
 		 2178 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  45.8 
 
 		 1439 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  46.04 
 
 		 1096 aa  87  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1008  CHAP domain-containing protein  35.61 
 
 		 562 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00120354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.49 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  45.21 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  51.14 
 
 		 1496 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  39.47 
 
 		 675 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  45.78 
 
 		 2002 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3122  Integrins alpha chain  36.79 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0941302  hitchhiker  0.000197077 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.53 
 
 		 690 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1025  hypothetical protein  37.33 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  48.94 
 
 		 2192 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  40.17 
 
 		 331 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  53.75 
 
 		 1537 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  30.36 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  45.87 
 
 		 1538 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1328 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  29.37 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.26 
 
 		 1154 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.17 
 
 		 861 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.21 
 
 		 940 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 539 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.36 
 
 		 1019 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.14 
 
 		 1225 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1517 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  29.49 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.92 
 
 		 1340 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  27.8 
 
 		 912 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 3193 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  32.88 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.48 
 
 		 3197 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  24.75 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1275  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.59 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.86 
 
 		 1126 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4549  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.82 
 
 		 690 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  26.42 
 
 		 417 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  28.92 
 
 		 872 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  25.29 
 
 		 1275 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1289 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  22.17 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  29.11 
 
 		 688 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  25.96 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.19 
 
 		 1009 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.96 
 
 		 889 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.64 
 
 		 8871 aa  44.3  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  26.75 
 
 		 685 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>