166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6310 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 828 aa  1601    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  39.29 
 
 		 1019 aa  257  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.32 
 
 		 2194 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.62 
 
 		 1340 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.5 
 
 		 1222 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.58 
 
 		 1113 aa  230  9e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.06 
 
 		 1118 aa  227  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.78 
 
 		 1225 aa  220  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  33.74 
 
 		 1838 aa  218  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.94 
 
 		 889 aa  213  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  37.22 
 
 		 2807 aa  210  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.95 
 
 		 891 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  47.81 
 
 		 760 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  32.32 
 
 		 1126 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.72 
 
 		 1009 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  30.77 
 
 		 872 aa  195  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.45 
 
 		 1012 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  34.07 
 
 		 1557 aa  178  3e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  37.02 
 
 		 386 aa  177  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  36.59 
 
 		 412 aa  157  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  34.33 
 
 		 604 aa  154  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  38.55 
 
 		 470 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  35.57 
 
 		 1275 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  36.13 
 
 		 688 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36 
 
 		 1490 aa  148  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  38.98 
 
 		 861 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.54 
 
 		 4379 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1289 aa  142  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.25 
 
 		 554 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  33.66 
 
 		 644 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.15 
 
 		 616 aa  136  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.73 
 
 		 539 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  40.09 
 
 		 1308 aa  127  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.24 
 
 		 974 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 1154 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.8 
 
 		 1372 aa  117  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  31.84 
 
 		 690 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.29 
 
 		 813 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4187  hypothetical protein  35.42 
 
 		 506 aa  114  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951598  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  32.11 
 
 		 3041 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  27.98 
 
 		 1124 aa  111  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  30.99 
 
 		 417 aa  111  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  36.82 
 
 		 472 aa  108  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.83 
 
 		 940 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39.26 
 
 		 662 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  30.92 
 
 		 912 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  30.29 
 
 		 409 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.28 
 
 		 3197 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  34.62 
 
 		 3193 aa  97.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.61 
 
 		 3197 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.86 
 
 		 657 aa  92.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  26.86 
 
 		 917 aa  92  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  34.53 
 
 		 469 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  29.64 
 
 		 685 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1638 aa  89.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  31.98 
 
 		 1094 aa  90.1  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  29.24 
 
 		 485 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  32.6 
 
 		 663 aa  87.8  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  30.45 
 
 		 494 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  31.46 
 
 		 447 aa  84  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  33.49 
 
 		 534 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  43.62 
 
 		 852 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 404 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 1022 aa  71.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2985  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 		 621 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.57 
 
 		 438 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  26.55 
 
 		 720 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2178  Integrins alpha chain  31.14 
 
 		 883 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297382  hitchhiker  0.000212806 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.31 
 
 		 11716 aa  67  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4648  hypothetical protein  59.38 
 
 		 110 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  25.83 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1127 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  27.17 
 
 		 1527 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.76 
 
 		 1114 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  46.24 
 
 		 161 aa  64.7  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.88 
 
 		 959 aa  64.3  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3124  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.07 
 
 		 868 aa  64.3  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199253  normal  0.898111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  27.31 
 
 		 437 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  25.44 
 
 		 437 aa  62  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  28.89 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  22.34 
 
 		 829 aa  60.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  50.52 
 
 		 560 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.77 
 
 		 524 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  32.62 
 
 		 2802 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  28.04 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  26.42 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  32.31 
 
 		 837 aa  57.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.05 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  24.65 
 
 		 433 aa  57.4  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6354  FG-GAP repeat protein  33.1 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.505611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  24.22 
 
 		 1346 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  26.89 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.14 
 
 		 510 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  29.3 
 
 		 658 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.53 
 
 		 1208 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  34.65 
 
 		 1428 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.77 
 
 		 3066 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  28.79 
 
 		 2497 aa  54.3  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  28.21 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>