150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3964 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0387  cadherin  71.07 
 
 		 938 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  100 
 
 		 940 aa  1848    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  70.79 
 
 		 3193 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  72.05 
 
 		 3041 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  68.33 
 
 		 690 aa  416  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  59.81 
 
 		 912 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.4 
 
 		 1154 aa  322  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.5 
 
 		 1372 aa  295  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  36.45 
 
 		 470 aa  184  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  29.96 
 
 		 626 aa  174  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  35.16 
 
 		 400 aa  174  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  29.84 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  33.27 
 
 		 401 aa  167  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.21 
 
 		 3427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  35.17 
 
 		 491 aa  164  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4891  hypothetical protein  47.9 
 
 		 337 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.504039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.61 
 
 		 501 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  35.66 
 
 		 403 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  34.81 
 
 		 760 aa  144  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  44.52 
 
 		 922 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 		 539 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  44.6 
 
 		 9867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.77 
 
 		 1019 aa  135  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 1017 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  31.83 
 
 		 840 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 1022 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.71 
 
 		 1838 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  28.48 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1969 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  36.7 
 
 		 1308 aa  124  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  31.58 
 
 		 378 aa  124  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  42.59 
 
 		 8871 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  27.22 
 
 		 528 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  30.36 
 
 		 688 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.26 
 
 		 813 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.01 
 
 		 430 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 		 917 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  28.71 
 
 		 582 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  35.68 
 
 		 2133 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.01 
 
 		 688 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.14 
 
 		 1848 aa  112  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  34.83 
 
 		 409 aa  111  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.75 
 
 		 828 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  45.33 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  31.9 
 
 		 4465 aa  108  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  39.73 
 
 		 2461 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.17 
 
 		 463 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  33.13 
 
 		 3508 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.06 
 
 		 456 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  38.78 
 
 		 2132 aa  106  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  38.55 
 
 		 2853 aa  105  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  34.67 
 
 		 391 aa  105  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1329 aa  104  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  34.32 
 
 		 3132 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  37.5 
 
 		 16311 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.03 
 
 		 14916 aa  102  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.87 
 
 		 2554 aa  101  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  32.89 
 
 		 417 aa  101  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.97 
 
 		 3954 aa  101  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  36.9 
 
 		 2820 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  30.07 
 
 		 432 aa  100  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  27.03 
 
 		 1131 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.46 
 
 		 3295 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  27.74 
 
 		 861 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  33.96 
 
 		 258 aa  99  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  33.94 
 
 		 3714 aa  99  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  27.41 
 
 		 471 aa  99  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 3363 aa  98.6  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  26.53 
 
 		 629 aa  98.2  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.05 
 
 		 436 aa  98.2  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  38.36 
 
 		 3391 aa  98.2  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1976 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 12741 aa  96.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  37.5 
 
 		 6678 aa  94.7  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.19 
 
 		 404 aa  95.1  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  28.11 
 
 		 917 aa  94.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  37.42 
 
 		 8980 aa  92.8  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.81 
 
 		 1855 aa  93.6  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.13 
 
 		 3089 aa  91.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.13 
 
 		 1862 aa  91.3  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  29.2 
 
 		 439 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  26.91 
 
 		 553 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  42.25 
 
 		 2001 aa  90.9  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 4334 aa  89.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.66 
 
 		 1272 aa  87  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  25.5 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 		 3066 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.67 
 
 		 480 aa  84.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0246  hypothetical protein  34.48 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  24.62 
 
 		 761 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 		 824 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.25 
 
 		 974 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  25.33 
 
 		 801 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  29.51 
 
 		 604 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.42 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  29 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  28.47 
 
 		 7284 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  24.74 
 
 		 553 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  35.42 
 
 		 200 aa  77.4  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  24.89 
 
 		 481 aa  77  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>