59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04420 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  961    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  39.9 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  32.3 
 
 		 1131 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  30.93 
 
 		 840 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.51 
 
 		 491 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  30.09 
 
 		 400 aa  180  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  30.68 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  31.22 
 
 		 528 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.75 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  39.11 
 
 		 258 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  26.98 
 
 		 559 aa  159  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  27.07 
 
 		 553 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.37 
 
 		 404 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  39.39 
 
 		 200 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  31.55 
 
 		 378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  30.19 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.59 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.67 
 
 		 870 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.18 
 
 		 629 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  26.36 
 
 		 408 aa  100  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.05 
 
 		 769 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.07 
 
 		 501 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  25.3 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  25.47 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.2 
 
 		 708 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  28.57 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  24.87 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  26.46 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24.09 
 
 		 940 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  24.09 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.39 
 
 		 1862 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  23.9 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  26.25 
 
 		 917 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  25.93 
 
 		 714 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  22.19 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  24.92 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.49 
 
 		 1848 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  25.62 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  23.73 
 
 		 2554 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  22.99 
 
 		 761 aa  57.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.68 
 
 		 938 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  25.23 
 
 		 603 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.36 
 
 		 696 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1287 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  19.51 
 
 		 575 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  25.14 
 
 		 889 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  23.24 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  23.26 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  21.97 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  23.08 
 
 		 456 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  24.41 
 
 		 450 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  21.82 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  22.68 
 
 		 669 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  23.93 
 
 		 1152 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 938 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.18 
 
 		 1272 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  24.64 
 
 		 3295 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  22.69 
 
 		 801 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>