39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0125 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 714 aa  1401    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  30.74 
 
 		 626 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  31.41 
 
 		 1131 aa  93.2  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  28.77 
 
 		 400 aa  87.4  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.18 
 
 		 401 aa  87  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  29.02 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.66 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  29.17 
 
 		 840 aa  77  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.27 
 
 		 403 aa  77  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.44 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.1 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  27.08 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.44 
 
 		 408 aa  70.5  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  25.78 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  34.93 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  26.26 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  29.33 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  23.28 
 
 		 870 aa  62  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  24.78 
 
 		 629 aa  61.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  30.82 
 
 		 200 aa  60.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.51 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  24.9 
 
 		 938 aa  59.3  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  23.39 
 
 		 917 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.23 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  25.3 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  25.63 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.39 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.53 
 
 		 940 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.76 
 
 		 382 aa  52.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1287 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  50.8  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  24.31 
 
 		 538 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  28.06 
 
 		 938 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  29.7 
 
 		 410 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  32.22 
 
 		 1848 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4731  WD40 domain protein beta Propeller  24 
 
 		 509 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.65 
 
 		 696 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  24.21 
 
 		 502 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  25.53 
 
 		 575 aa  43.9  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>