76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0436 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  100 
 
 
391 aa  773    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  40.95 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  40.66 
 
 
400 aa  276  5e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  39.2 
 
 
401 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  39.67 
 
 
491 aa  252  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  35.06 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  33.42 
 
 
404 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  34.03 
 
 
626 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  34.73 
 
 
1131 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  35.29 
 
 
840 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  35.2 
 
 
408 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.24 
 
 
629 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.02 
 
 
870 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  27.18 
 
 
528 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  37.86 
 
 
258 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  27.18 
 
 
410 aa  118  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  27.81 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  26.74 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  26.51 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  28.19 
 
 
502 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  29.26 
 
 
432 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  27.71 
 
 
417 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  30.75 
 
 
940 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.33 
 
 
382 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.34 
 
 
501 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  36 
 
 
200 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.16 
 
 
2068 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  29.24 
 
 
1287 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  26.41 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.47 
 
 
3507 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  28.28 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  28.52 
 
 
938 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  28.52 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  25.52 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.9 
 
 
917 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  28.14 
 
 
538 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  27.9 
 
 
938 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  28.96 
 
 
480 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.51 
 
 
769 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  29.82 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.25 
 
 
696 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  27.57 
 
 
2286 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  28.1 
 
 
714 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.86 
 
 
4433 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.17 
 
 
1272 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.56 
 
 
2807 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  22.05 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.22 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  23.83 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  29.61 
 
 
439 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  28.38 
 
 
513 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  23.26 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  23.84 
 
 
456 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  28.08 
 
 
485 aa  60.1  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.54 
 
 
708 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  28.34 
 
 
1862 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  24.63 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.42 
 
 
1848 aa  56.6  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  24.8 
 
 
368 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  22.87 
 
 
477 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  23.6 
 
 
2864 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  22.54 
 
 
471 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24.33 
 
 
2198 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  26.58 
 
 
1933 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.27 
 
 
688 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0151  hypothetical protein  28.26 
 
 
472 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  24.65 
 
 
425 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  24.89 
 
 
669 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  33.61 
 
 
553 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  23.46 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  29.71 
 
 
460 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.76 
 
 
1329 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.27 
 
 
603 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  25.75 
 
 
1532 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  25.81 
 
 
864 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  32.65 
 
 
950 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>