34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1245 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 429 aa  852    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  29.04 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  29.67 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  33.16 
 
 		 626 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.71 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  29.5 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  34.69 
 
 		 840 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  27.07 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.22 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.78 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  34.75 
 
 		 1131 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.03 
 
 		 940 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.82 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  27.43 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  26.21 
 
 		 200 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  25.46 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.22 
 
 		 870 aa  63.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  29.33 
 
 		 714 aa  63.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.33 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.59 
 
 		 708 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  33.58 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  21.22 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.22 
 
 		 696 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  31.68 
 
 		 938 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.89 
 
 		 559 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.81 
 
 		 382 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  25.22 
 
 		 553 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  25 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  29.05 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  26.12 
 
 		 575 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  27.36 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.69 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  26.47 
 
 		 410 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.87 
 
 		 538 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>