51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2739 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  861    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  37.92 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  38.27 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  38.76 
 
 		 491 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  39.36 
 
 		 400 aa  189  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  33.24 
 
 		 629 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  33.62 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  34.97 
 
 		 840 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  32.96 
 
 		 626 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.28 
 
 		 870 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  32.46 
 
 		 258 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  27.96 
 
 		 553 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  27.71 
 
 		 559 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  26.86 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.71 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.38 
 
 		 378 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.96 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  34.86 
 
 		 200 aa  99.8  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  29.72 
 
 		 502 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.52 
 
 		 528 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  35.06 
 
 		 538 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  28.23 
 
 		 1131 aa  89.7  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  27.96 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  30.1 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  25.6 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  31.36 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1287 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  23.96 
 
 		 940 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  27.64 
 
 		 917 aa  64.7  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  24.86 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  26.91 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 		 1272 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  22.98 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  26.37 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  26.07 
 
 		 387 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  24.82 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  29.05 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.7 
 
 		 769 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  29.79 
 
 		 714 aa  50.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.6 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.46 
 
 		 708 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  37.7 
 
 		 938 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  22.56 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  22.52 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  21.52 
 
 		 938 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25 
 
 		 480 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  23.21 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  23.89 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  20.99 
 
 		 688 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  21.28 
 
 		 696 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  22.18 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>