31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0640 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  795    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.4 
 
 
403 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.51 
 
 
629 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  26.32 
 
 
400 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  26.96 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.4 
 
 
401 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.08 
 
 
404 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  27.08 
 
 
258 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.55 
 
 
626 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.01 
 
 
432 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  29.85 
 
 
538 aa  86.3  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  30.1 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  24 
 
 
840 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  25.52 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.55 
 
 
870 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  26.94 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  27.75 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  25.19 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  26.19 
 
 
553 aa  67  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  26.49 
 
 
559 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  30.8 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  25.41 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.84 
 
 
481 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  27.85 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  23.21 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  19.94 
 
 
385 aa  53.5  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.2 
 
 
1272 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1367  hypothetical protein  24.74 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144169  hitchhiker  0.000000182251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  25.19 
 
 
440 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.15 
 
 
1131 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  30.83 
 
 
2864 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>