27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0236 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  780    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.54 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.18 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.85 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.15 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  23.26 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  20.34 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  24.91 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  20.19 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  23.28 
 
 		 840 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.45 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  20.67 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  19.54 
 
 		 404 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1287 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  22.92 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  23.57 
 
 		 626 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  23.58 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.52 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  24.44 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  24.61 
 
 		 559 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  28.21 
 
 		 258 aa  47  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  23.22 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  23.21 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 1131 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  30.61 
 
 		 200 aa  44.3  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  22.38 
 
 		 460 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>