86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2495 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  917    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  35.6 
 
 		 831 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.75 
 
 		 1272 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 930 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  36.02 
 
 		 668 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  33.22 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 676 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  36.11 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  36.18 
 
 		 387 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.01 
 
 		 930 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  40.53 
 
 		 343 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  36.05 
 
 		 664 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  30.9 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  35.98 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  34.14 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  34.07 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  31 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  33.43 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.59 
 
 		 447 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.95 
 
 		 752 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  30.05 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.73 
 
 		 940 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.98 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  32.65 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  29.2 
 
 		 938 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  26.74 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.61 
 
 		 963 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  31.27 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.13 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  32.85 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1750 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  32.43 
 
 		 786 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.15 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  31.21 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.23 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.65 
 
 		 1292 aa  60.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.28 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.41 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.46 
 
 		 2296 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1351 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.72 
 
 		 2068 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.9 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  23.76 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1030 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  26.71 
 
 		 801 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  28.01 
 
 		 646 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.6 
 
 		 401 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.19 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  25.74 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2616  WD40 repeat, subgroup  48.61 
 
 		 145 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173979  normal  0.948356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.33 
 
 		 1848 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  34.15 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  27.88 
 
 		 384 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.28 
 
 		 1130 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1146 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 688 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  31.96 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.06 
 
 		 4433 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.47 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1667 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  19.81 
 
 		 994 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.34 
 
 		 917 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0023  putative YD repeat protein  28.72 
 
 		 683 aa  47.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  30.29 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 		 621 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1026 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1608 aa  46.6  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1763 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  25.6 
 
 		 1140 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1051 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.58 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  27.4 
 
 		 538 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.39 
 
 		 1079 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.44 
 
 		 2277 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  24.7 
 
 		 1531 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  23.2 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  22.38 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.49 
 
 		 626 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  29.14 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  26.94 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.81 
 
 		 603 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.23 
 
 		 2554 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>