68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1046 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  806    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  43.2 
 
 
400 aa  270  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  43.79 
 
 
491 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  44.48 
 
 
401 aa  260  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  42.63 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  38.06 
 
 
629 aa  199  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  35.61 
 
 
378 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  32.35 
 
 
840 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  34.56 
 
 
626 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  34.41 
 
 
391 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  29.88 
 
 
559 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  30.12 
 
 
553 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  33.62 
 
 
417 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  30.1 
 
 
432 aa  149  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  34.42 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  30.66 
 
 
870 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  37.65 
 
 
258 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  35.79 
 
 
1131 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  35.62 
 
 
502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  30.36 
 
 
528 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  26.56 
 
 
481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  40.83 
 
 
200 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  28.08 
 
 
405 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  26.61 
 
 
472 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.83 
 
 
769 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.57 
 
 
708 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  33.2 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.19 
 
 
940 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  25.13 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  32.78 
 
 
1287 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  28.66 
 
 
538 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  28.82 
 
 
477 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.12 
 
 
501 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  27.23 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  22.15 
 
 
575 aa  77.4  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  27.34 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.49 
 
 
4433 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  29.44 
 
 
450 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  27.08 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.71 
 
 
938 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.96 
 
 
2068 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.04 
 
 
1862 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  26.67 
 
 
938 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  23.93 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  23.98 
 
 
456 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  26.84 
 
 
3507 aa  63.2  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  28.33 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  26.56 
 
 
2864 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.38 
 
 
1272 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  24.26 
 
 
917 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.49 
 
 
2286 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  26.64 
 
 
513 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  24.21 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  24.22 
 
 
368 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  24.38 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.5 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  19.54 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  29.52 
 
 
669 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  23.53 
 
 
688 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  21.33 
 
 
436 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25.52 
 
 
480 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  24.48 
 
 
425 aa  49.7  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.08 
 
 
1848 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.64 
 
 
696 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  20.95 
 
 
1329 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.7 
 
 
1531 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  28.95 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  24.33 
 
 
529 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>