49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2666 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  99.28 
 
 
553 aa  1097    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1120    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  33.7 
 
 
840 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  32.7 
 
 
400 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  33.41 
 
 
491 aa  211  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  29.96 
 
 
626 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  32.35 
 
 
403 aa  196  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.61 
 
 
401 aa  192  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  29.31 
 
 
404 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  34.77 
 
 
258 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  26.98 
 
 
481 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  25.75 
 
 
528 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.34 
 
 
629 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  34.7 
 
 
200 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  30.77 
 
 
1131 aa  123  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.53 
 
 
378 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  27.15 
 
 
417 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  28.49 
 
 
432 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  26.51 
 
 
391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.15 
 
 
870 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  26.36 
 
 
408 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  27.93 
 
 
502 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  23.7 
 
 
538 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  29.6 
 
 
477 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.13 
 
 
769 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  23.5 
 
 
410 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24.55 
 
 
940 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  22.86 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  26.43 
 
 
405 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  23.93 
 
 
387 aa  67  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  23.46 
 
 
1848 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  22.64 
 
 
669 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.32 
 
 
938 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.51 
 
 
708 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  31.49 
 
 
1287 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.51 
 
 
382 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24.23 
 
 
714 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  23.4 
 
 
430 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  24.89 
 
 
429 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  21.01 
 
 
472 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  23.84 
 
 
463 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  24.61 
 
 
385 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  19.9 
 
 
575 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  22.57 
 
 
696 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  23.47 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  23.28 
 
 
456 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  22.92 
 
 
889 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1918  hypothetical protein  32.43 
 
 
84 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  23.08 
 
 
1862 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>