71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1424 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  100 
 
 
840 aa  1684    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  42.01 
 
 
626 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  38.98 
 
 
491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  44.6 
 
 
400 aa  274  6e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  41.35 
 
 
401 aa  266  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  43.63 
 
 
403 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  54.03 
 
 
258 aa  230  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  33.7 
 
 
559 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  33.26 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  32.67 
 
 
528 aa  210  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  32.13 
 
 
1131 aa  199  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  35.08 
 
 
629 aa  196  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  32.35 
 
 
404 aa  188  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  29.53 
 
 
481 aa  179  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  32.93 
 
 
432 aa  171  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  51.58 
 
 
200 aa  167  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  35.29 
 
 
391 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  34.97 
 
 
417 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.41 
 
 
870 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2063  hypothetical protein  35.51 
 
 
249 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00115023  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.64 
 
 
378 aa  138  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  33.51 
 
 
472 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  31.75 
 
 
940 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  31.04 
 
 
408 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.74 
 
 
708 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  29.89 
 
 
502 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.54 
 
 
769 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  25.43 
 
 
538 aa  103  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  29.74 
 
 
410 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  27.03 
 
 
382 aa  94.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.25 
 
 
938 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  24 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.99 
 
 
430 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  34.69 
 
 
429 aa  80.1  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  26.56 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  29.17 
 
 
714 aa  77  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  28.89 
 
 
917 aa  74.3  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.41 
 
 
696 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.25 
 
 
456 aa  72  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.65 
 
 
1862 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.49 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  26.69 
 
 
669 aa  67.8  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.43 
 
 
1287 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.35 
 
 
1848 aa  64.3  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.96 
 
 
688 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  22.66 
 
 
387 aa  62.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  24.46 
 
 
938 aa  62  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.51 
 
 
471 aa  60.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  23.72 
 
 
368 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  27.59 
 
 
575 aa  59.7  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  23.51 
 
 
480 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  23.28 
 
 
385 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  27.59 
 
 
439 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.79 
 
 
1531 aa  55.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  24.42 
 
 
425 aa  54.7  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  23.69 
 
 
436 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.58 
 
 
2554 aa  53.5  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 
1532 aa  53.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  25.45 
 
 
421 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  20.63 
 
 
1272 aa  51.6  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  23.34 
 
 
889 aa  50.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  20.97 
 
 
529 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  23.75 
 
 
761 aa  50.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.82 
 
 
1111 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  22.22 
 
 
1329 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.32 
 
 
2068 aa  47.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  27.87 
 
 
553 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  28.4 
 
 
485 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  26.51 
 
 
2864 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  25.69 
 
 
603 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>