86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1874 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  100 
 
 
603 aa  1180    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  31.99 
 
 
801 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.41 
 
 
1862 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  31.53 
 
 
761 aa  163  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  33.41 
 
 
812 aa  153  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  32.05 
 
 
1531 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.25 
 
 
2554 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.39 
 
 
3295 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  34.46 
 
 
1532 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  30.77 
 
 
1152 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  28.18 
 
 
1111 aa  99  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.29 
 
 
1230 aa  97.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  87  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  29.81 
 
 
501 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  30.2 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.12 
 
 
472 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  50 
 
 
1313 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  31.27 
 
 
430 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  45.98 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  28.3 
 
 
553 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.27 
 
 
940 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  46.43 
 
 
830 aa  75.1  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1500  hypothetical protein  40.4 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  43.18 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  26.05 
 
 
1131 aa  68.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  40.24 
 
 
143 aa  64.7  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  24.92 
 
 
938 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31 
 
 
1976 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 
665 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  35.37 
 
 
2296 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  36.14 
 
 
133 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40 
 
 
1806 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  41.57 
 
 
1632 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.9 
 
 
1272 aa  57.4  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  24.46 
 
 
439 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  40.74 
 
 
592 aa  57  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
696 aa  55.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  24.9 
 
 
258 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.9 
 
 
2796 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  24.17 
 
 
463 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  37.5 
 
 
2342 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  37.5 
 
 
2342 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  32.76 
 
 
1805 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  50 
 
 
1880 aa  51.6  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.86 
 
 
626 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.9 
 
 
528 aa  52  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
756 aa  51.6  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
1075 aa  51.2  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.8 
 
 
849 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
361 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
995 aa  50.8  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  24.61 
 
 
481 aa  50.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 
857 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  38.1 
 
 
223 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.23 
 
 
456 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  37.63 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  23.76 
 
 
513 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 
872 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
361 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  27.75 
 
 
200 aa  49.3  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  40.74 
 
 
120 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  25.29 
 
 
436 aa  49.7  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.02 
 
 
491 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  26.48 
 
 
485 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  38.33 
 
 
736 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  40.74 
 
 
115 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.16 
 
 
471 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  40.74 
 
 
644 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 
824 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  22.97 
 
 
917 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  23.5 
 
 
401 aa  47  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  35.8 
 
 
678 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.73 
 
 
2286 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  25.69 
 
 
840 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
1264 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
846 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  35.48 
 
 
227 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 
746 aa  45.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
1067 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  29.68 
 
 
950 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.57 
 
 
1969 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.93 
 
 
1848 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  25 
 
 
400 aa  44.3  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.27 
 
 
391 aa  43.9  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  37.04 
 
 
255 aa  43.9  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>