15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0939 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  853    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  22.55 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  20.78 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  24.41 
 
 		 387 aa  57  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  27.33 
 
 		 258 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  24.42 
 
 		 840 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.4 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  22.9 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  22.67 
 
 		 626 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.65 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  24.48 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  25.48 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.61 
 
 		 870 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.65 
 
 		 408 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  25.48 
 
 		 200 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>