76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1444 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  86.29 
 
 
200 aa  327  9e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  56.65 
 
 
626 aa  270  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  54.03 
 
 
840 aa  230  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  51.54 
 
 
400 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  50.19 
 
 
401 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  52.21 
 
 
491 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  44.81 
 
 
403 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  43.97 
 
 
528 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  40.74 
 
 
432 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  38.22 
 
 
481 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  43.04 
 
 
629 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  41.48 
 
 
1131 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  39.23 
 
 
559 aa  155  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  39.23 
 
 
553 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  37.65 
 
 
404 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  32.46 
 
 
417 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  37.86 
 
 
391 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.2 
 
 
769 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  34.2 
 
 
408 aa  105  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  31.64 
 
 
870 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  29.78 
 
 
378 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  32.85 
 
 
708 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.17 
 
 
940 aa  98.6  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  36.36 
 
 
538 aa  97.1  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  29.44 
 
 
405 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  30.95 
 
 
410 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 
472 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  29.37 
 
 
477 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  29.02 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  32.32 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  27.07 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.2 
 
 
938 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  29.44 
 
 
714 aa  74.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.14 
 
 
1287 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.95 
 
 
917 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  29.61 
 
 
575 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.87 
 
 
1862 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.11 
 
 
430 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  25.11 
 
 
387 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  28.37 
 
 
938 aa  55.8  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  25.95 
 
 
421 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.38 
 
 
501 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  27.33 
 
 
425 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.9 
 
 
603 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.54 
 
 
696 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  34.75 
 
 
669 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  26.2 
 
 
761 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  29.53 
 
 
471 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  31.25 
 
 
456 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.03 
 
 
1848 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  30.32 
 
 
3507 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  23.28 
 
 
2864 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  24.51 
 
 
889 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  29.24 
 
 
858 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  26.7 
 
 
2554 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  29.21 
 
 
436 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  24.06 
 
 
368 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.79 
 
 
1230 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  28.57 
 
 
463 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.23 
 
 
2068 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  28.21 
 
 
385 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.71 
 
 
1531 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.61 
 
 
1111 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.96 
 
 
2807 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  32.31 
 
 
688 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.65 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  25.51 
 
 
1532 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.65 
 
 
2286 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  31.29 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  26.92 
 
 
901 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.27 
 
 
8871 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3309  hypothetical protein  27.32 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  21.61 
 
 
3563 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  27.33 
 
 
513 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1773  hypothetical protein  26.26 
 
 
516 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.659619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>