215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0418 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0418  PKD  100 
 
 
626 aa  1252    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  42.01 
 
 
840 aa  323  6e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  39.17 
 
 
481 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  56.65 
 
 
258 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  40.73 
 
 
400 aa  270  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  38.48 
 
 
1131 aa  259  9e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  36.77 
 
 
528 aa  257  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  42.82 
 
 
491 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  40.42 
 
 
403 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  40.52 
 
 
401 aa  252  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  58.58 
 
 
200 aa  207  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  29.96 
 
 
559 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  31.36 
 
 
553 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  38.48 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  34.56 
 
 
404 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  34.29 
 
 
391 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  32.17 
 
 
629 aa  180  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.76 
 
 
940 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  47.5 
 
 
582 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.66 
 
 
870 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  51.63 
 
 
1236 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  32.59 
 
 
472 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  34.07 
 
 
408 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  32.96 
 
 
417 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.26 
 
 
538 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.22 
 
 
938 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.97 
 
 
769 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  28.75 
 
 
382 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  30.94 
 
 
477 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.44 
 
 
1862 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  25.39 
 
 
2554 aa  97.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.26 
 
 
917 aa  93.2  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  25.3 
 
 
502 aa  91.3  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.56 
 
 
501 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  25.55 
 
 
405 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  33.16 
 
 
429 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  24.94 
 
 
410 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  30.4 
 
 
708 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.28 
 
 
1287 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  24.87 
 
 
3295 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  25.91 
 
 
714 aa  81.3  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  48 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  47.5 
 
 
838 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.13 
 
 
735 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  54.84 
 
 
2036 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  55.56 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  27.51 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  39.62 
 
 
1282 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  50 
 
 
941 aa  74.3  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  48.68 
 
 
2272 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  53.23 
 
 
1969 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  47.22 
 
 
1120 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.35 
 
 
930 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36 
 
 
675 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  48 
 
 
669 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  53.23 
 
 
1241 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.56 
 
 
930 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  56 
 
 
996 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  59.02 
 
 
910 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  57.89 
 
 
1361 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  53.23 
 
 
1300 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  57.14 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  53.23 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  40.95 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  55.56 
 
 
561 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  57.75 
 
 
530 aa  70.9  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  39.62 
 
 
791 aa  70.5  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  55.38 
 
 
963 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  39.84 
 
 
644 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  53.23 
 
 
1842 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  51.61 
 
 
1682 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  51.61 
 
 
575 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.67 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.45 
 
 
184 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  51.61 
 
 
1882 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  43.9 
 
 
859 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  46.67 
 
 
1667 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48 
 
 
752 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.84 
 
 
1667 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  50 
 
 
1387 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  45.78 
 
 
816 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  25.62 
 
 
761 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  50 
 
 
2122 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  49.4 
 
 
971 aa  68.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  48.53 
 
 
869 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  55.38 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  42.68 
 
 
713 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  39.58 
 
 
685 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  50 
 
 
978 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  55.38 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  59.02 
 
 
439 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  45.88 
 
 
1531 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  46.38 
 
 
1094 aa  67.4  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  20.43 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  55 
 
 
2000 aa  67.4  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  47.62 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50.65 
 
 
528 aa  67  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  33.59 
 
 
500 aa  67  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>