More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1471 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  58.82 
 
 		 713 aa  766    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  100 
 
 		 685 aa  1394    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  55.89 
 
 		 658 aa  705    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  79.1 
 
 		 679 aa  1061    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  63.03 
 
 		 675 aa  783    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  62.25 
 
 		 669 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50.69 
 
 		 581 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  71.39 
 
 		 1682 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  50 
 
 		 560 aa  462  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  68.77 
 
 		 735 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  69.64 
 
 		 752 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  68.71 
 
 		 1094 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  68.98 
 
 		 2272 aa  445  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  67.78 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  63.59 
 
 		 1300 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  65.36 
 
 		 1882 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  63.46 
 
 		 859 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  65.66 
 
 		 2036 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  64.16 
 
 		 1842 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  61.84 
 
 		 1969 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  64.37 
 
 		 1120 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  62.72 
 
 		 1241 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  62.69 
 
 		 978 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  62.57 
 
 		 2122 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  61.98 
 
 		 2000 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  63.17 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  76.21 
 
 		 547 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.97 
 
 		 971 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  76.23 
 
 		 791 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  76.21 
 
 		 551 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  52.89 
 
 		 1667 aa  353  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  51.11 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  52.29 
 
 		 1361 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.11 
 
 		 1356 aa  325  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.88 
 
 		 963 aa  319  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  50.3 
 
 		 528 aa  316  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  50 
 
 		 1862 aa  312  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  47.17 
 
 		 1282 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  52.62 
 
 		 930 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.95 
 
 		 530 aa  295  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.16 
 
 		 938 aa  294  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  48.85 
 
 		 2554 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  48.33 
 
 		 838 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  47.75 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.38 
 
 		 941 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.78 
 
 		 958 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  56.35 
 
 		 3295 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  48.23 
 
 		 910 aa  261  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 		 1732 aa  257  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  42.12 
 
 		 1001 aa  256  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.99 
 
 		 1236 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  73.45 
 
 		 184 aa  253  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  42.53 
 
 		 869 aa  252  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.86 
 
 		 861 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.07 
 
 		 1667 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  46.04 
 
 		 1387 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  38.86 
 
 		 1528 aa  240  8e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.3 
 
 		 1783 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  68.52 
 
 		 644 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.58 
 
 		 823 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40.41 
 
 		 1292 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.66 
 
 		 443 aa  217  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.07 
 
 		 840 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.76 
 
 		 719 aa  210  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.69 
 
 		 930 aa  210  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  33.21 
 
 		 870 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  30.65 
 
 		 769 aa  205  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  40.71 
 
 		 802 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  37.12 
 
 		 952 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.48 
 
 		 845 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  46.03 
 
 		 2552 aa  192  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  40.99 
 
 		 1011 aa  190  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  31.43 
 
 		 771 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  39.94 
 
 		 929 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.98 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  42.27 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  40.3 
 
 		 374 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  45.3 
 
 		 1095 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  54.49 
 
 		 519 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  38.84 
 
 		 2176 aa  178  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.75 
 
 		 819 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 777 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  36.59 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.16 
 
 		 1531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  38.04 
 
 		 960 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.59 
 
 		 1814 aa  172  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  39.68 
 
 		 1189 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  36.27 
 
 		 865 aa  168  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  37.76 
 
 		 379 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  35.65 
 
 		 1380 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  29.65 
 
 		 819 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  53.53 
 
 		 1231 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  42.19 
 
 		 821 aa  155  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.47 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  41.94 
 
 		 408 aa  152  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  41.26 
 
 		 848 aa  150  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.48 
 
 		 816 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  43.55 
 
 		 1620 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  45.79 
 
 		 996 aa  146  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.99 
 
 		 1931 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>