292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0425 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0425  PKD  100 
 
 
1231 aa  2528    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  30.63 
 
 
1095 aa  360  8e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  29.18 
 
 
1292 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  30.73 
 
 
847 aa  285  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  31.07 
 
 
862 aa  284  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  42.9 
 
 
996 aa  266  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  41.62 
 
 
941 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  43.28 
 
 
1042 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  27.39 
 
 
909 aa  221  8.999999999999998e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  25.87 
 
 
941 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.28 
 
 
929 aa  182  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  26.68 
 
 
892 aa  178  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  56.47 
 
 
669 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  57.06 
 
 
713 aa  169  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  56.47 
 
 
658 aa  168  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  52.11 
 
 
1094 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.96 
 
 
735 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  54.12 
 
 
679 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  53.55 
 
 
581 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  55.29 
 
 
675 aa  164  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  53.11 
 
 
752 aa  163  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  47.06 
 
 
551 aa  161  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  53.53 
 
 
685 aa  159  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  48.68 
 
 
791 aa  158  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  39.05 
 
 
3295 aa  157  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  37.4 
 
 
1092 aa  154  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  50.59 
 
 
859 aa  154  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  41.23 
 
 
930 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  48.44 
 
 
1882 aa  154  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.82 
 
 
1732 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  38.6 
 
 
910 aa  154  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  38.27 
 
 
218 aa  154  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.63 
 
 
2036 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  31.97 
 
 
616 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.82 
 
 
547 aa  152  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  48.19 
 
 
615 aa  151  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.19 
 
 
978 aa  151  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  51.18 
 
 
1282 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  39.71 
 
 
1120 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.83 
 
 
575 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.79 
 
 
963 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  41.92 
 
 
778 aa  149  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.09 
 
 
2554 aa  149  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.92 
 
 
1862 aa  147  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.65 
 
 
865 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.65 
 
 
1300 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  45.73 
 
 
1842 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  51.5 
 
 
1356 aa  147  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  50.88 
 
 
644 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.83 
 
 
1682 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  39.26 
 
 
1241 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  50.91 
 
 
561 aa  146  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  48.07 
 
 
560 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  45.95 
 
 
1236 aa  145  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  46.59 
 
 
1361 aa  145  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.65 
 
 
184 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.45 
 
 
1328 aa  141  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.72 
 
 
958 aa  141  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  48.63 
 
 
2000 aa  141  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  46.11 
 
 
528 aa  141  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.79 
 
 
930 aa  141  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.77 
 
 
1969 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  36.11 
 
 
2272 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  47.34 
 
 
1667 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.57 
 
 
2122 aa  135  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  44.97 
 
 
719 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.59 
 
 
816 aa  134  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  40.3 
 
 
460 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  42.47 
 
 
500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  45.7 
 
 
519 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  43.02 
 
 
1667 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  39.59 
 
 
1931 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  40.4 
 
 
400 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  42.22 
 
 
870 aa  125  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.69 
 
 
530 aa  125  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  42.16 
 
 
2552 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  48.39 
 
 
861 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 
840 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  42.46 
 
 
1311 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.44 
 
 
1387 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  47.02 
 
 
1528 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  45.51 
 
 
443 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.12 
 
 
786 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  45.4 
 
 
838 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  31.84 
 
 
848 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.64 
 
 
823 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.6 
 
 
802 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  42.22 
 
 
777 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 
845 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.39 
 
 
819 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  30.88 
 
 
300 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  40.96 
 
 
869 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  37.56 
 
 
1783 aa  110  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  38.95 
 
 
1011 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.7 
 
 
938 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 
918 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2053  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.35 
 
 
777 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  39.9 
 
 
1531 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3047  hypothetical protein  34.54 
 
 
325 aa  109  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  36.41 
 
 
1380 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>