38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2513 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  45.19 
 
 
941 aa  644    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  94.19 
 
 
862 aa  1551    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1723    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  41.98 
 
 
909 aa  570  1e-161  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  36.78 
 
 
892 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  44.56 
 
 
773 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  48.26 
 
 
616 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  31.43 
 
 
1231 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  41.13 
 
 
300 aa  217  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  32.25 
 
 
754 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1308  hypothetical protein  44.09 
 
 
361 aa  192  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0304738  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  33 
 
 
340 aa  173  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  23.9 
 
 
1292 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  24.35 
 
 
1095 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  37.9 
 
 
356 aa  154  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  36.4 
 
 
346 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  33.76 
 
 
339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  33.7 
 
 
347 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  34.69 
 
 
303 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0631  hypothetical protein  39.47 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.606141  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  30.28 
 
 
576 aa  97.8  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  29.18 
 
 
828 aa  95.9  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0595  hypothetical protein  43.81 
 
 
196 aa  94.4  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1535  hypothetical protein  26.65 
 
 
811 aa  83.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0148901  hitchhiker  0.00829639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  40.35 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  23.06 
 
 
929 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  29.58 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1180  hypothetical protein  28.22 
 
 
312 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.111365 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1964  hypothetical protein  27.39 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.833026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2457  hypothetical protein  39.62 
 
 
186 aa  64.3  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2025  hypothetical protein  34.19 
 
 
205 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0865236 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  24.58 
 
 
593 aa  55.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0799  hypothetical protein  31.68 
 
 
201 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  24.64 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1183  hypothetical protein  28.7 
 
 
194 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.780381  normal  0.0653972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  26.61 
 
 
400 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  31.53 
 
 
176 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1178  hypothetical protein  27.78 
 
 
207 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>