More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6157 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
918 aa  1848    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  56.08 
 
 
788 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  45.33 
 
 
884 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  62.42 
 
 
753 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  60.49 
 
 
710 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6937  hydrolase  61.11 
 
 
504 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000451446  normal  0.0387498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  47.96 
 
 
586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  46.12 
 
 
1243 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  52.1 
 
 
691 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  47.65 
 
 
675 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.79 
 
 
581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  36.23 
 
 
663 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.11 
 
 
735 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40.66 
 
 
1236 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.73 
 
 
859 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  46.29 
 
 
910 aa  125  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  46.55 
 
 
551 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  46.8 
 
 
930 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  46.67 
 
 
615 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.82 
 
 
669 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  47.13 
 
 
679 aa  124  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  38.14 
 
 
1300 aa  124  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.88 
 
 
658 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  49.04 
 
 
752 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.4 
 
 
1682 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  44.26 
 
 
713 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  46.55 
 
 
685 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  38.89 
 
 
2036 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.82 
 
 
1882 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  50.32 
 
 
561 aa  119  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  36.72 
 
 
1862 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  32.04 
 
 
1094 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.72 
 
 
1969 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  37.18 
 
 
547 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.9 
 
 
3295 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.64 
 
 
791 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.2 
 
 
560 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.59 
 
 
651 aa  114  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  44.25 
 
 
2272 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.4 
 
 
1842 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  45.6 
 
 
2000 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35.86 
 
 
575 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  44.92 
 
 
978 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  45.51 
 
 
1361 aa  112  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  37.16 
 
 
938 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.52 
 
 
1732 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  39.69 
 
 
930 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  41.54 
 
 
963 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.05 
 
 
1241 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  38.14 
 
 
1120 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  36 
 
 
1231 aa  110  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  43.09 
 
 
2122 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  44.25 
 
 
1667 aa  109  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  49.03 
 
 
2554 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  44.08 
 
 
644 aa  108  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  48.94 
 
 
935 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  41.04 
 
 
958 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  36.67 
 
 
528 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  38.6 
 
 
816 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.45 
 
 
184 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  42.44 
 
 
1667 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  42.77 
 
 
936 aa  104  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.28 
 
 
951 aa  104  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  42.77 
 
 
936 aa  104  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  56.86 
 
 
1199 aa  104  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  36.46 
 
 
500 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  35.75 
 
 
996 aa  103  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  50 
 
 
460 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40 
 
 
1387 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  42 
 
 
965 aa  102  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  41.46 
 
 
1328 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  34.26 
 
 
941 aa  101  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  42.57 
 
 
861 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.38 
 
 
1282 aa  99.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  41.09 
 
 
1783 aa  100  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  38.3 
 
 
400 aa  99  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  41.18 
 
 
945 aa  96.3  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.65 
 
 
838 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.41 
 
 
802 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.29 
 
 
840 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  39.05 
 
 
1528 aa  96.3  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  40.13 
 
 
938 aa  95.5  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
1356 aa  94.7  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  36.32 
 
 
1931 aa  94.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 
583 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  34.86 
 
 
929 aa  94  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  36.74 
 
 
816 aa  93.6  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  39.01 
 
 
443 aa  94  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.31 
 
 
719 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  36.36 
 
 
848 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.23 
 
 
845 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  39.34 
 
 
519 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  36.96 
 
 
3197 aa  92.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.1 
 
 
786 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.73 
 
 
3197 aa  92  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 
870 aa  90.9  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.8 
 
 
474 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.57 
 
 
819 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  40.62 
 
 
1311 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  39.29 
 
 
940 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>